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标题:【讨论帖】（表观）遗传学/转化医学

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发表于 2016-4-11 14:18 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

应该没有问题，那几个大峰是蓝色的，ATGC都不是蓝色，并没有影响你的测序结果。
你也可以咨询一下测序公司问问是怎么回事？一般来说是没有的。可能是试剂不太好，出现的杂乱信号。
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发表于 2016-4-11 14:25 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

好像C 峰就应该是蓝色的吧？ A是绿，T是红，G是黑啊。
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发表于 2016-4-11 14:26 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
我最近在做SET结构域基因进化分析。
我一直有个想法，不知道怎么样？
甲基化是靠某些基因甲基化，SET基因就是负责甲基化的基因，那么这个基因的表达高低就能体现到甲基化的程度，通过控制这个基因的表达（当然还有除甲基化基因），是否发现某些基因被甲基化调控呢？（调控SET基因，影响甲基化）。
不知道我这个想法合理吗？
这个只是我大概的想法，我现在主要在做SET结构域基因进化分析，毕业论文，谁做相关方面的研究我们可以讨论下。
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发表于 2016-4-11 14:26 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
楼主老师的思路很好，可是我想请教一下，用去甲基化药物处理后，恢复表达的基因可能有数百个，那样的话怎样去找出有用的抑癌基因的 是需要把这样的基因都做RT-PCR在肿瘤组织和正常组织中验证 然后再用MSP验证吗 这样的话会不会很耗时？有什么好的方法 因为刚刚开始接触表观遗传 希望老师不吝赐教
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发表于 2016-4-11 14:27 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

我想向各位前辈请教一个极端幼稚的问题，请各位不吝赐教：外界或内部的环境导致了一个印迹基因的印迹缺失，那么我们通过药物或者其他手段干预，这个印迹基因会恢复吗？它恢复的周期可能是多长时间啊？再者，一个疾病它的某个基因的CpG岛甲基化异常，通过药物或者其他干预，这个甲基化的异常会改变吗？
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any333[使用道具]
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发表于 2016-4-11 14:43 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
目前我也在看dnmt1和组蛋白修饰对dna甲基化的影响，zeb据报道可以抑制dnmt1的表达，而tsa又是组蛋白去乙酰化抑制剂。所处理的细胞是植入前胚胎。初步预测它两是协同作用，共同去甲基化。
dna甲基化和组蛋白修饰之间的相互关系还没搞懂，而一定是神秘的联系着
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any333[使用道具]
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发表于 2016-4-11 14:45 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
印记基因形成于配子形成过程中，认为干预再恢复这似乎很难实现
通过药物改变甲基化很正常，外界环境很容易导致甲基化变化
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cj_mondy[使用道具]
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发表于 2016-4-11 14:56 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

表观遗传 甲基化引起发育分化
那么从白细胞提取出的DNA得出的表观状态
应该不能反映其他组织某一个基因的表观遗传状态吧
假设这一基因在干细胞有表达合成某种蛋白质
而在白细胞不能合成
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发表于 2016-4-11 14:56 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
DNA的不同甲基化修饰是导致组织分化的机制之一，因此，按理说不同的组织中至少组织特异性表达基因是应该具有不同 的甲基化谱的。
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wiwi[使用道具]
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发表于 2016-4-11 15:20 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
各位同行 那位是在做全基因组甲基化分析的啊 我最近就在做不同动物不同组织的全基因组甲基化分析 想通过这个方法找到一些对一个性状有影响的基因 不知道这样可行否 请各位赐教
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