细胞世界

根据细胞内底物运送到溶酶体腔方式的不同，哺乳动物细胞自噬主要可分为三种方式 [Crotzer et al., 2005]：大自噬（Macroautophagy）、微自噬（Microautophagy）和分子伴侣介导的自噬 (Chaperone-mediated autophagy)。

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大自噬（Macroautophagy）即我们说的自噬（autophagy）
微自噬（Microautophagy）：是指溶酶体主动、直接吞噬胞浆成分的一种方式。
分子伴侣介导的自噬 (Chaperone-mediated autophagy，CMA)：一些分子伴侣，如hsc70，能帮助未折叠蛋白转位入溶酶体。
另外，几个与phage相关的概念：
吞噬（phagocytosis）：细胞主动吞掉胞外的细菌、碎片、或其它细胞。
吞饮（pinocytosis）：胞外的液体
异噬（heterophagy）：吞噬、吞饮的统称，强调所吞内容物来自细胞外，它们都是单层膜的液泡。
自噬体（autophagosome）形成后，可与吞噬泡或吞饮泡融合，然后再与溶酶体融合，但这一过程的证实还需更多的实验来支持。

自噬小体的增多有两种可能：一是形成增加即自噬被诱导；另外一种是自噬体成熟受抑即自噬体不能和溶酶体结合。该怎么来判断呢？
另外，我们在神经系统中检测LCⅡ，使用western blotting，好像不怎么灵敏，还是因为它存在的时间较短？

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自噬体增多，也就是“自噬潮”出现的原因一是形成增多，二是与溶酶体融合受阻（如使用了氢化氯喹或氯喹，另外，溶酶体的酶抑制剂和质子泵抑制剂的使用亦有可能影响溶酶体与自噬体或异噬泡的融合），使自噬体不能降解而积聚，这种积聚造成的自噬体增多的效应要大于自噬体诱导剂效应的数倍之多。
鉴于这样的原因，单纯的GFP-LC3荧光斑点增多不足以作为自噬激活的证据，可联用多个方法来判断：
1）加用自噬体与溶酶体融合的抑制剂，如氯喹，观察自噬潮的变化。
2）或加用LC3和溶酶体示踪物在荧光显微镜下观察共定位情况。
3）或Knockdown掉LAMP-2基因（溶酶体膜蛋白）。
4）检测胞浆长寿蛋白的降解。
Western Blot检测LC3时除了上述的原因外，还有几个需考虑到的地方：
1）抗体的亲和力：有报道认为LC3抗体对II型LC3的亲和力较高
2）结合于自噬体内层膜的LC3-II在与溶酶体结合后被降解。
3）自噬过程很快，一个自噬体从产生到降解仅需2~3个小时或更短，其中自噬体形成阶段更迅速，数分钟即可完成，而溶酶体降解阶段耗时相对较长。因此，设置多个检测时间点（time frame）是非常重要的。

以autophagy命名的杂志
cuturl('http://www.landesbioscience.com/journals/autophagy/')

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我们这边投过几篇，知名度不是太高，毕竟是新办的。
该杂志影响因子开始有6-7分，去年降到4点多，变化比较大，今年的也不知道还会不会降。