样品前处理

大家好，我一个计划里，涉及的DNA太长（60个碱基），现在老板想变短，然后检测效果与选择性都不影响。大家以前见过这类方法吗？ 我不知道老板的想法合理否？


我看了下DNA的二级结构，其中茎环有27个碱基，不知道茎环是不是结合靶点？


请过来人指教

可以的。一般有十来个碱基对选择性就足够了。

变短的话，应该怎么变短？我可以把两边切掉10个碱基，最后剩下来40个碱基。还是选择其中的茎环结构，27个碱基？

怎么切要看你的下一步。比方要把切出来的片段整合到质粒DNA中，就要考虑连接酶的需要。如果没有任何其他限制条件，我会选氢环上的一部分。