比较蛋白质组学

做乳酸菌的差异蛋白，找不到差异点啊，什么原因呢？老外的文章都只从几百个里面找到10－20个。我一个都找不到。郁闷啊。

版主将你的问题发给了我。可要回答你的问题需要更多的实验信息。如你需要并希望找到实验问题所在，请提供更多信息。如你想私下讨论，请问版主行不行，怎样进行。

可能差异处理强度不够，或者分离条件设计的不好，再就是差异检测能力不够（可用DIGE技术提高差异检测灵敏度）。

1  可能实验组和对照组的差异很小，因为我们平常都要选取表达量大于或者小于2陪以上的才算是差异，当然这也是为了消除各实验操作上的误差，可有种变化就只相差1.5陪，而且是很稳定的差异，我觉得这也是可以接受的，当然还需要别的实验来验证这种差异是真实存在的
2 另外还有可能是差异的蛋白表达量低而你采取的染色方法不能检测到，这样可以采用分级分离、去除高丰度蛋白、或者用窄的PH梯度或者是DIGE等技术以提高低丰度蛋白的检测效率。

首先一点，你用的方法和文献中的方法一样吗？如果方法不一样，提出的蛋白也不是全一样的。
如果是同样的方法，可能就是你实验的问题了。