iPhone助力生命科学研究

从iPhone apps到云计算,新型数字技术推动着药物研发,临床治疗,医药护理的发展。尤其是目前销售火热的iPhone系列产品,能实现你所想象不到的生命科学研究帮助,这包括记录患者病情,指导实验,用作高性能显微镜等等,相信这些新发展的功能将会给我们越来越多的惊喜。
AsthmaMD
来自加州大学旧金山分校的儿科医生Sam Pejham去年接诊了一位哮喘病小患者,这个小男孩出现了劳累,失眠,和体重下降的症状,虽然这是Pejham第一次给这位患者看病,但是他却明白患者的哮喘并不容易控制,这时他瞧见了小男孩妈妈的手机。这让他灵机一动,Pejham一直在寻找能记录患者情况的方法,比如哮喘的肺功能记录,为此他进行了多方面的尝试。
最终他发明了一个iPhone软件:AsthmaMD,这个程序能帮助患者记录症状,比如可以根据输入的年龄,身高,性别来计算相对应的尖峰呼气流速(PEFR),在对比输入的数据,判断患者病情的严重程度。并可以通过每天记录这些症状,服用的药物,完成哮喘病情记录日志,有了这个日志,医生就能很方便的判断患者近期的病情,并由此来制定更完善,有益的治疗方案。
MIQE qPCR app
这一qPCR实验指导由Bio-Rad公司赞助,慕尼黑工业大学的Michael W. Pfaffl教授和拉萨尔–博韦综合理工学院的Afif Abdel Nour副教授这两位实时定量PCR方面的专家开发,目前可从苹果的App Store商店免费获得。这项新的应用为研究人员提供了必要的资源和核对表,以确保他们的qPCR实验遵从MIQE。
MIQE(Minimum Information for Publication of Quantitative Real-Time PCR Experiments), 简称mykee,是一套在国际上最新推出的指导方针,就评价QPCR实验和发表文章时所必需的实验信息提出了最低限度的标准, 也提供了一个出版时所要附带的checklist。

MIQE qPCR app帮助研究人员实现了qPCR实验的准确、透明和可靠。该应用中不同颜色的核对表区分了必要和可取的MIQE要求,并直观地显示了过程。用户可直接链接到MIQE相关的文献,或者通过电子邮件向专家询问有关qPCR或MIQE的问题。应用中有着最新的qPCR资源、参考文献和新闻。
Promega iPhone App和NEB Tools
升级版Promega iPhone App包括了生命科学计算软件(BioMath Calculators),这些计算软件提供了简单而又便利的方法,可用于计算熔解曲线、摩尔数、稀释倍数、DNA和蛋白质的浓度,以及其它常用的DNA和蛋白质的换算。这些计算软件以前出现在Promega公司网站上,现在,Promega公司将它们引入iPhone,可为使用者提供更多的便利,十分适合科学家在实验台上随时查阅。
Promega App(version 1.2)不仅含有操作方案和应用指南(Protocols & Applications Guide)中的信息--包括操作方案、参考资料以及产品信息,同时还加入了生命科学研究人员经常用到的计算软件。
除此之外,NEB也推出了NEB Tools,这一软件将NEB最受欢迎的网站工具加入到iPhone中。Restriction Enzyme Finder让你能通过限制性序列或名称来寻找NEB的限制性内切酶。Double Digest Finder则能帮助你确定双酶切的缓冲液和反应条件。
几个分析软件
Molecules:这是一款浏览蛋白质三维结构的应用程序。你想快速浏览蛋白质结构吗?只需打开Molecules应用程序,就能通过PCSB蛋白数据库浏览或下载。
Genetic Code:提供了每个氨基酸的多个信息,包括化学结构、编码该氨基酸的所有密码子、侧链电荷、极性、分子量、pI等。
iProtein:随时随地查看蛋白质的结构。
高性能显微镜
今年美国的科学家开发出一种非常便宜的方法,可以将iPhone手机的摄像头变成显微镜,用于在缺少设备的地区进行疾病分析。
通过在iPhone手机的摄像头上安装一个1mm大小的球形镜头,可以实现5x放大率――能够拍摄到血细胞进行分析。由于每张照片中只有一小部分区域能够合焦,所以他们还使用了对焦堆叠的方法――将对焦在不同位置的多张照片拼合――获得可用的最终照片。

该方案最令人兴奋的地方在于其极其低廉的价格――每支镜头仅需40美元,如果进行量产还会更加便宜。
(生物通