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标题:[讨论贴]单细胞凝胶电泳技术及应用讨论

一叶[使用道具]
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回复 #20 乌贼老弟 的帖子

您的问题很好,说明您善于思考,呵呵。细胞肯定要用低熔点胶混合,铺胶前低熔点胶PBS溶解、煮沸,要温于37度水浴箱,再和细胞混合,不会破坏细胞,而正常熔点凝胶就做不到了,正常熔点胶要煮沸后立即铺胶,否则温度降低,就凝固了。
我也赞成您的想法,因为我就是用的双层铺胶法,根本不用铺第三层,有文献报道只铺一层胶,呵呵,那就更简单了。
我没做过H2O2,不敢妄加评论,但是,试验结果要通过科学的统计学分析后得出结论的,我不知道您说的“区别不大”是否经过了统计学分析呢?如果预实验时您发现了前几个剂量的效应无差别的话,可以在正式试验中保留其中的一个剂量,当然最主要的还要看它和阴性对照组之间有无差别。我觉得初次用这个方法做毒性试验的话,一定要找到和阴性对照组之间有差别的最小剂量,然后剂量逐步提高,如知道半数致死剂量就更好了,有了两个坐标,在这两个剂量之间选择剂量,当然,在大于半数致死剂量还要选择一定剂量,随着剂量的增加,必然会出现从某一个剂量以后,大于此剂量的若干组之间都没有了差别,那就以此剂量造成的损伤作为100%(如尾长、尾矩、OLIVE尾矩等等好多指标可测),首、尾都有了,中间就好办了!可以根据这个剂量范围,继续做凋亡细胞率的观察,看看这个指标怎么样。
个人看法,不一定合理,仅供参考,见笑了。
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园丁##[使用道具]
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谈一些我的经验,希望有所帮助。

我们用有机玻璃板自制了一套架子,按照电泳槽的大小制作一个托架,可直接放进电泳槽(托架上打孔使电泳液自然流动,否则胶会被冲跑)。托架可以放置8个载玻片托架。载玻片托架与载玻片同宽,略长,按载玻片大小粘上4个有机玻璃小块,载玻片可以嵌入托架。

关于铺胶,我们只铺一层,说是铺胶不如说是“滴”胶。载玻片倾斜,用较大口的玻璃滴管滴在靠上部分,胶会自然流动形成。非常薄的胶使得彗星图象更清晰。每个玻片可以找到20-60个有效细胞。

图像系统直接用摄像头接在显微镜上。摄像头的线性要好。我使用中性滤片校准灰度值。穷人只能因陋就简。几万的摄像头可买不起。因为一个图像一个细胞,分析可以批量处理。
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很感激两位高手的指点,真的是帮助很大啊,呵呵。
我现在胶的问题基本上解决了,看来一个试验应该注意的细小的地方真的是很多,我还得踏下心来一点一点的解决问题,说实话问了这么多的问题真怕大家烦了,昨天还有点担心大家不会再给我解答问题了呢,呵呵。看来担心是多余的了,一叶 老师辛苦你了,感谢万分!同样的谢意也送给园丁##!

PS:希望还能继续讨论!
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对了,你们用的分析软件是CASP吗?我怎么下载不下来啊,听说还有KOMET5.5,不过我下载了之后装不上去,现在手头上有image pro plus,是不是应该用专业的用于分析彗星试验的软件要好一点啊,3Q
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我没用过CASP 或 KOMET, Image Pro用过但不适合分析彗星试验的图像,我的软件是自己写的,没有UI 。输入一系列采集的图像,自动分析每个图像,结果保存在CSV文件中,验证结果可以浏览输出的图像(叠加头、尾的边界)。

我已经很久没做过彗星试验了。看到人家KOMET都在卖,而我的程序早已不知去向,在我以前研究所的某张软盘上

CASP 是OpenSource的,可以自己按照你的需要更改,可以试试。如果每张图片都要人工介入去分析,太累了。
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问啊,EB的致癌性那么强,那么用过的玻片应该怎样处理啊,呵呵,现在觉得整天接触EB很危险
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一叶[使用道具]
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玻片我也不知道怎么特殊处理,我只是每天做完试验后把胶板用镊子刮掉,玻片用水反复冲洗后,把玻片泡在一个专用的盆里,第二天再用蒸馏水洗,我也不知道这样行不行。再有,试验过程中要严格隔离,我当时做试验的时候,开始实验就带上医用乳胶手套,中间还要换新的,直至结束,一天下来,手就像水泡馒头一样,呵呵,是有点辛苦。
还有,建议您把用于拍照的数码相机保护好,因为带手套的手要按快门的,所以最好把相机外面套一层塑料罩。
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一叶[使用道具]
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SCGE是想补充一下资料,或是使您的实验更完美和有说服力。如果您选择SCGE的话,会有短期的一段时间比较累,但是实验进展很快,时间不会长,估计不会耽误您的毕业。关键是SCGE的摸索过程,因为您从未做过这个实验。 按您所说,做药物的毒性实验,可查的文献比较多,可以参考,想必您也通过文献了解了不少了吧?SCGE的方法学各个实验室都不太一样,但是实验主线不会变。先设计好您的实验,预实验时摸索一下方法,比如药物浓度、剂量、时间等等。预实验中只要能出来结果,您就成功了一半,然后按设计好的实验进行,会很顺利,所以,实验设计是比较关键的一个好的导师会帮助你设计一个比较好的实验,如果在实验过程中再去改设计,那就太被动了!
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一叶[使用道具]
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取血-淋巴细胞分离-铺胶-裂解-解旋-电泳-染色-荧光显微镜观察-拍摄
这是全过程,其实不难,有什么问题尽管提,我尽量帮您。
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dotaaa[使用道具]
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回复 #29 一叶 的帖子

我其实一点实验都还没做,我还有8个月的时间,前一阵子一直在变方向,老是确定不下来做什么。我很惨的,导师是搞行政的,没有人能帮我,我全都是自己设计。看了很多文献,但是光看不做什么效果也不会有。
我不清楚你研究的方向是什么,如果是毒理或相近的话请帮帮我,我出些钱过来做实验好吗?
我一个人实在无法撑下去了。而且我们实验室那边都不是做毒理的,根本没实验条件。
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