随着分子生物学技术的发展，原位杂交技术也在不断和完善，已被广泛应用于生物研究领域中，并展示其优越性。一些原位杂交公司提供的原位杂交技术的基本程序主要有组织取材与固定、组织切片的处理、杂交反应、杂交后处理和杂交体的检测。
原位杂交技术可以在分子水平上研究特定的核酸序列或基因定位以及基因表达调控，这一技术最初是应用于动物染色体上的基因物理定位和特定mRNA在组织中的空间定位，后来有作为诊断工具检测感染病毒的细胞。在医学方面，如今原位杂交技术以广泛应用于遗传学、病毒学、神经内分泌学、病理学、免疫学、肿瘤学和发育生物学等各个领域。越来越多的原位杂交公司不断采用新技术和新方法来完善其原位杂交服务。原位杂交的组织标本常规处理方法主要有以下4种。
1、玻片处理
玻片包括盖玻片和载玻片，应使用热肥皂水刷洗，自来水清洗干净后，置于清洁液中浸泡24h，清水洗净烘干，95%酒精中浸泡24h后蒸馏水冲洗、烘干过夜，烘箱温度最好在150℃或以上；或者用1‰的DEPC浸泡过夜后高压灭菌烘干，以去除RNA酶。为防止切片脱落，可预先将载玻片用黏附剂包被，常用的黏附剂有明胶-铬明矾、APES（氨丙基三乙基硅烷）、多聚赖氨酸。将黏附剂预先涂抹在玻片上，干燥后待切片时应用。
美迪西提供生物实验服务，其生物部在体外生物学领域有丰富广泛的经验，通过酶水平测定、细胞水平测定、细胞生物学、生物化学、体外同位素测定、稳定细胞株建立、基因敲除、RNAi和MicroRNA技术等，提供一套完整的生物学服务。
2、冰冻切片
冰冻切片是酶组织化学和免疫组织化学染色中最常用的一种切片方法，其最突出的优点是能够较完好地保存细胞膜表面和细胞内多种酶活性以及抗原的免疫活性，尤其是细胞表面抗原更应采用冰冻切片。新鲜组织和已固定的组织均可作冰冻切片。为了得到高质量的冰冻切片，选择好的冰冻切片机是保证切片质量的关键。恒冷箱切片机是目前最常用的冰冻切片机，可得到3—5um的连续薄片。
组织在切片前需要冰冻，而冰冻过程容易使组织中的水分形成冰晶，从而影响抗原定位。一般认为，冰晶体积大而量少时，影响较小；冰晶体积小而量多时，对组织结构损害较大。含水量较多的组织中较易出现冰晶。
3、石蜡切片
动物经4%多聚甲醛溶液灌注固定后，迅速取下待检测组织，经其他固定液再固定，按常规石蜡切片步骤进行切片。把修好的蜡块装在旋转切片机上，即可进行切片。石蜡切片要在0.04%DEPC水中展篇和裱片，制成的石蜡切片置37~42℃烤箱中过夜后方可进行原位杂交，经烤干的切片可以在室温下保存。
切片必须保持切片刀锐利，切片厚度通常为5～7um，也可根据染色需要切成不同厚度，一般不旋转式切片机超过10um。切好的蜡带，放人40℃左右的温水中将蜡片展平。良好的切片应无刀痕、裂痕，切片厚度均一平整。
切片如果出现刀痕、裂痕和切片厚度不均一平整的问题时，在进行免疫组织化学染色时会出现假阳性现象。为能得到平整无皱褶的组织切片。可采用两次展片，即先将组织切片漂浮在30％的乙醇溶液中进行第一次展片，然后将切片捞起，再次放人45～50℃的水浴中进行第二次展片，乙醇的浓度和水温可视组织不同和石蜡熔点的高低自行调整。此过程是利用乙醇溶液与水之间的张力差展开切片的皱褶。为防止脱片，载玻片要涂黏片剂。对HE染色的切片，可在载玻片上涂抹薄层蛋白甘油，但蛋白甘油因含蛋白易导致非特异性免疫反应，故用于免疫组织化学染色的切片常用多聚赖氨酸、3—氨丙基—乙氧基甲硅烷等处理。
4、细胞标本
制作培养的细胞标本常用离心法，先将生长在培养瓶壁上的细胞用胰蛋白酶处理，制成1*10^5/mL个细胞的细胞悬液，经离心制成细胞离心标本。使细胞贴附于经处理的载玻片上，空气干燥1~2min后浸渍固定，再经PBS和蒸馏水漂洗后置37℃干燥保存或在70%酒精中4℃保存，随时可以用于原位杂交。如果细胞直接生长在载玻片或盖玻片上，则可将长有细胞的载玻片或盖玻片直接固定，然后用缓冲液漂洗，置37℃温箱干燥4H以上，再进行原位杂交。
原位杂交技术是基因表达研究强有力的手段，它可以在细胞标本或组织标本上进行。这一技术不需要从组织细胞中提取核酸，对组织中含量极低的靶序列有很高的灵敏度，并可保持组织与细胞的结构完整，反映特异核酸分子的定位。特别是配合使用能定位特异蛋白分子的免疫细胞化学技术，就能对生理或病理条件下从DNA到mRNA到蛋白质这样一个基因表达过程进行定性和定位的分析。因此原位杂交技术在生物研究领域的作用巨大。
