蛋白质与蛋白组学

目前只能做固态芯片检测，不能制作固态芯片，准备制作液态芯片！
大师看可行吗？

液态芯片原理

编码微球：分别用不同配比的两种荧光染料将直径5.6μm的聚苯乙烯微球（Beads）染成不同的荧光色，从而获得多达100种经荧光编码的微球。

交联探针、抗体或抗原：把针对不同检测物的核酸探针、抗体或抗原以共价方式结合到特定荧光编码的微球上。
激光分析：微球成单列通过两束激光，一束判定微球的荧光编码；另一束测定微球上的报告分子的荧光强度。

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大家做的都好新啊,

请问楼主老师,
我想把我所需要的蛋白键合到带有羟基的小球上面, 怎么才能失去的活性最小,而又最有效呢?

相关疾病：
肿瘤

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谢谢你！能问出这样问题的人一看就是个专家了，也说明你思考了很多。中国多有一些你这样的人会是一个幸事！
下面是个人对此的观点，偏颇的地方欢迎争鸣。坦率的讲，胡应该是中国做芯片的科学家中商业化做的最好的人之一，2001年开始试产C12到2002"入选"年度公众关注的中国十大科技事件"，C12的宣传做的很好，05年3月又得到了正式批文，国际首例蛋白芯片实践产品的头衔也给数康带来了较好的经济利益。从技术上讲，肿瘤标志物蛋白芯片现在已经比3年前成熟许多，已经比较稳定，C12系统和金标准的阳性符合率应该在80%左右，而且本身的多指标检测又可以相互验证其准确性，很少在出现检测结果惊吓正常人的事情了。至于有时出现的假阳性很多是由于系统阈值，标本处理和个体差异造成的，只有他们公司的技术人员足够努力，经过调整会慢慢好起来。个人认为蛋白芯片应该还是有前途的，好的靶标，特异性抗体，芯片基质是其中较为重要的几个研究方面，国人应好好钻研才是。国外的应用产品是不多，也是国情和各自审批机构的条文所限，就当做另一个国内特色吧。
至于这些抗体芯片的保质期，如果使用玻璃基质，一般在半年左右；多聚物膜的在保存方面要好一些。另外，点样液的配方也会影响到抗体的保存时间。运输到没有什么特殊要求。欢迎和你继续讨论！

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谢谢你的分析，我现在的想法是，做这样广谱的肿瘤标记物芯片觉得特异度灵敏度还不够，可否把这个想法做专一点，比如12种标记物针对某一种特定的肿瘤，现在每种肿瘤的标定物大多都超过5种，临床主要还是应用一些免疫试剂盒来完成，如果把这些试剂盒的抗体集中一下都拿来做成一张芯片，也就是一张芯片针对一种肿瘤，是否会大大提高诊断预测的能力和术后复查的能力。有一个想法我们有点不谋而合，那就是国外的医疗制度决定的发展方向，他们大多是私人诊所，大医院的就诊量和国内不可同日而语，也许这就决定了他们芯片公司的发展方向。
让我隐隐担忧的最大的因素不是技术上的，而是国家的药品管理机构，对市场引导和管理能力之低下，“个别人员”之Fu Bai 程度令人发指。

请问怎么来保证结合在蛋白芯片上样品的天然生物活性，基质和固定方法对天然生物活性有影响吗？最好选择那种方法呢？

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1）不同基质的确对蛋白保存有很大影响，简单的说玻璃基质的保存效果比三维芯片要差一些。
2）固定方法，如巯基、醛基、环氧基等也有一定影响，其中环氧基较好。

Pooled Standard Deviation是针对研究对象中子数据结构，从根本上看是对σwithin的一种无偏估计，也就是说将实验组的内部偏差进行无偏化处理（无偏系数为C4）。现在据我所知还没有人把这一方法应用于蛋白芯片上，但根据前述理论，这种方法看起来也没有什么不可以扩展到蛋白方面的。

我们目前在分析一组患者在治疗前后的数组基因变化，能否将这些患者的蛋白混合后点一张芯片，然后将治疗前后的两张芯片进行比较。观察哪些蛋白发生了改变，然后再用免疫组织化学来进一步研究发生变化的蛋白的变化程度，以及在哪些患者中发生变化。不知这样是否可行

这个想法很新颖，个人鼓励你尝试，如果有好结果在来和我讨论，设计时注意以下几点：
1）你应该用的是膜，2Dgel系统。
2）先把预实验证实的无关蛋白组分去除。
3）样本量要足够大，否则个体差异会掩盖目标数据。
4）如果你能用到免疫组化方法，说明你已经有抗体了，那么又何必。。。

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因为标本量比较大，如果一张张地做下去，需要很多的工作量，所以想出这样一个点子，通过芯片进行初筛，如果幸运的话找到新的蛋白（那当然更好）如果找不到也可以通过这种方式节约些时间精力。

我的课题是用蛋白芯片检测差异蛋白,看了上面的贴子,受益匪浅,我是用SELDI 检测的,最近遇到了一个很麻烦的问题,我先用SAX2(强阴离子交换)把实验和对照组蛋白扫了一下,发现有差异蛋白,接下来想用不同PH值的洗脱液分馏蛋白,但是查不同的文献发现用不同的洗脱液,有用Tris-HCL ,有的用磷酸钠和醋酸钠什么的,真是搞不明白到底这不同的洗脱液到底有什么不同,希望得到大家的帮助,谢谢

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1）不同的洗脱液本身没有什么区别。
2）PH值影响洗脱效果和收率更为重要。