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标题:【讨论帖】western blotting试验技术讨论

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三、转膜
1、膜的选择 从结合蛋白的能力上看,PVDF膜(100-200微克/平方厘米)比硝酸纤维素膜(80-100微克/平方厘米)高;就物理强度而言,硝酸纤维素膜较脆,易破碎,而PVDF膜韧性较强;但是硝酸纤维素膜的背景较PVDF膜要低。另外,对于小分子量的蛋白(小于20kDa)一般用0.2微米孔径的膜,而大分子量的蛋白一般用0.45微米孔径的膜。
2、戴上手套接触油纸、凝胶和膜,因为手上有油脂会阻断转移。
3、排去滤纸、胶和膜之间的气泡,因为气泡会产生短路。
4、转移后效果的鉴定:染胶:考马斯亮蓝检测极限可达1.5微克
染膜:一般采用丽春红,染色后,色素可以被洗掉,膜可以用做进一步分析。
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四、封闭和杂交
1、常见的封闭液有BSA和脱脂奶粉,脱脂奶粉的封闭能力比较强,一般我们采用5%的脱脂奶粉溶于TBST中作为封闭液。
2、一抗与二抗我们用5%的BSA或TBST进行稀释;一抗我建议4度过夜,这样抗原抗体结合更充分。
3、0.1%Tween-20溶于TBS中配成洗涤液,在一抗与二抗结合完毕后洗膜三次,减少由于抗体粘附而引起的非特异性显色。
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我做了半年的western blotting,从一个新手到基本完成western blotting试验,也谈一些个人的经验,仅供同学们参考学习:
1:灌胶:现在到冬天了,气温低,胶不容易凝,可开启空调 提高室温,或则加大TEMED的量。
2:玻璃板第一次用可以泡酸过夜,以后就用洗衣粉洗干净即可 然后在烘箱里烤干 就可以灌胶了
3:加样的时候 ,未加样的孔加SDS上样缓冲液,避免边缘效应
4:一抗稀释液我用的是0.5%BSA,用TBS稀释,二抗稀释液用的是3%脱脂奶粉 效果不错
5:膜接触了金属(比如镊子等),容易导致荧光淬灭,和膜接触的东西最好保持干净 比如保鲜膜,曝光夹等
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做了三个月的western blot,有些心得想和大家一起分享。
1、组织蛋白提取
组织蛋白提取方面得明确自己所要提的蛋白定位在细胞的哪个位置,胞浆、细胞膜、细胞核,不同位置的蛋白提取方法是不一样的。本人检测的指标是大鼠肾脏组织核蛋白,刚开始直接采用碧云天裂解液P0013B来提取蛋白质,说明书介绍说裂解核蛋白能力相当强,就按照说明书提蛋白的步骤提取总蛋白,可是提取的总蛋白经电泳后发现蛋白在浓缩胶压缩的很不理想,估计是直接提取肾脏组织总蛋白浓度太高的原因(BCA定量显示 180000ug/ml),因而不合适,后来采用专门的核蛋白裂解液配方才成功提取了核蛋白。因此,我觉得碧云天的裂解液并不是万金油,还是得根据具体情况选择最佳的蛋白提取液。
2、灌胶
首先一定要将玻璃板清洗干净。早晨清洗玻璃板时,可用洗洁精或者洗衣粉等清洗玻璃板,然后在60℃的烤箱里把水分烤干。烤干的玻璃板再装上,一般就不会漏。检测是否会漏胶我是先灌蒸馏水,5min内若蒸馏水的液面不下降或者只降低一点点那就不影响灌胶了,可放心配胶。分离胶加的量不可太多,否则上样泳道就过浅,减少了上样量。分离胶的聚合时间最好保证有40min的聚合时间,虽然多加了过硫酸铵和TEMED的话可以加快聚合速度,但是我不推荐。认真做好一块胶是做好后续实验的基础。
3、电泳
从历届师兄以及个人实验,我觉得蛋白样品在浓缩胶时的电压为80V,时间为20min左右,在分离胶时可以提升到110V,直至溴酚蓝将抛出为止,整个电泳时间大概在120min左右,当然分离胶浓度不同的话时间会有所差别。
4、转膜
多次的实验摸索让我对转膜颇有心得。有条件的话最好用新鲜配制的转移缓冲液,最好不要超过三次,否则缓冲液的成分发生改变,你用同样的转膜条件就不一定能有一样好的转膜效果了。个人觉得似乎恒压转膜要强于恒流转膜,虽然有人说采用恒压转膜可能会因为甲醇的挥发导致电流不平稳,不利于转膜,但我采用恒压效果还是相当不错的。
5、封闭
我们实验室采用10%的脱脂奶粉封闭,时间一般为2~3h,但是我是封闭过夜,效果不错,背景淡,特异条带突出。当然这跟一抗、二抗的稀释度也是有关系的。背景很深的园友可以考虑4℃封闭过夜。
6、一抗
刚开始一抗稀释度的摸索可以按说明书上限的两倍来摸索,比如说明书说1:100~1:500,我们可以从1:1000来摸索,我的指标就是这样子,其他人也很多这种情况,好的结果一抗的稀释度不一定在说明书的稀释范围。
一抗的孵育时间最好是室温摇床2h后再放入4℃冰箱过夜,利于抗原抗体结合。
7、二抗
二抗的孵育时间为1.5h~3h,不想等的话1.5h就够了,一般是2h
8、漂洗
用TBST漂洗PVDF膜 15min*3次 TBST最好两天换一次,放置过久,吐温失效。
9、曝光
在暗室里曝光时若能看到目的蛋白的荧光条带最好不过,若是不能看到也不要气馁,可以压片10min,再看看曝光效果。另外胶片从显影液取出放置定影液之前时 先过一下水 可以延长定影液的使用时间。我观察到用久了的定影液定影时间显著长于新配的定影液,若你发现定影得花上2min时间时,说明你的显影液定影液都得换了。。。。
不足之处, 请其他战友多多补充,一起交流。。。。
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把WB的步骤和注意事项贴出来吧,供大家参考:
1. 把聚丙烯酰胺凝胶中的蛋白质电泳转移到硝酸纤维膜上。
1)转移缓冲液洗涤凝胶和硝酸纤维素膜,将硝酸纤维素膜铺在凝胶上,用5ml移液管在凝胶上来回滚动去除所有的气泡。
2)在凝胶/滤膜外再包一张3mm滤纸(预先用转移缓冲液浸湿),将凝胶夹在中间,保持湿润和没有气泡。
3)将此滤纸/凝胶/薄膜滤纸按照厂家建议方法放入电泳装置中,凝胶面向阴极。
4)将上述装置放入缓冲液槽中,并灌满转移缓冲液以淹没凝胶。
5)按照厂家所示接通电源开始电泳转移。
6)转移结束后,取出薄膜和凝胶,弃去凝胶。
2. 将薄膜漂在氨基黑中快速染色,直至分子量标准显现时取出,记录下标准位置。
3. 用100ml水洗涤纤维素膜,必要时可用脱色缓冲液。
4. 膜置印迹缓冲液中于37℃保温1小时。
5. 室温下,用PBS-Tween缓冲液洗涤薄膜。
6. 用封口机将薄膜封入塑料袋中,尽可能不留空气。
7.袋的一角剪一缓冲液的小口,用透析袋夹紧。
8.混合:NGS(100微升),印迹缓冲液中的抗体(10毫升),加在装薄膜的袋中,于室温下摇动2小时(或4℃过夜)
9.用总体积300ml PBS-Tween缓冲液,分4次在一浅盘中洗涤薄膜,每次75ml。
10. 将连接生物素的羊抗兔IgG(40微升溶于10毫升印迹缓冲液/100微升 NGS)加在袋内,于室温下摇动1小时。
11.按步骤9洗涤。
12.加入抗生素蛋白-HRP(40微升溶于10毫升印迹缓冲液/100微升 NGS),于室温下摇动。
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现在天气冷,我们做胶曾经1.5个小时都不凝,后来将胶加水封后放入37度隔水式培养箱,很快就凝了(约25分钟),而且胶的质量也不错,经实验证实没有差别。
需要注意的是放入培养箱内动作要轻,且保持水平,否则做出来的胶是斜的且后面加浓缩胶后交界线不平整。
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我是新手,发现显影之后有些带有点朦胧不清晰,而且有时候带呈现弯曲状态,有的好像连跑胶的时候的泳道也显出来了,这是什么原因呢?
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MARKER显出来是怎么回事呢?
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现在天气冷,我们做胶曾经1.5个小时都不凝,后来将胶加水封后放入37度隔水式培养箱,很快就凝了(约25分钟),而且胶的质量也不错,经实验证实没有差别。
需要注意的是放入培养箱内动作要轻,且保持水平,否则做出来的胶是斜的且后面加浓缩胶后交界线不平整。

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请问你的胶中AP浓度是多少?通过增加AP的量可以促进胶凝固,但不能太大否则很快凝固。我们分离胶一般10ml胶中加10%AP为80-100ul即可;而浓缩胶一般6ml中加10%AP为60ul左右即可。
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我是新手,我来谈谈我的经验和教训:
1,膜一定要标好蛋白面,否则实验多了,特别是膜放久了,stripping后重新做时容易搞不清蛋白面。我一般常规在蛋白面朝下的左上角上剪缺。
2,电泳时间:浓缩胶时的电压为100V,时间为20min左右,在分离胶时可以提升到200V,直至溴酚蓝将跑出止,或者目的条带到板子下三分之一就可以了。整个电泳时间大概在60min左右,当然分离胶浓度不同的话时间会有所差别。
3,转膜建议湿转,较半干转效率高,而且不容易转过。
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