ttsRNA在细菌转录调节中的作用

研究者在肺炎支原体中发现了一类在基因组中广泛存在的小RNA，它们位于转录起始位点（transcription start site, TSSs）周围，因此称为tssRNAs。这种小RNA在大肠杆菌中也检测得到。

与最近在真核生物中鉴定出来的与启动子结合的tiRNA相似，tssRNAs也与激活的启动子结合。实验表明，这些小RNA与转录流产的RNA不同（流产RNA长度较短），这些单链RNA平均长度为45个碱基。在基因组中，几乎每个ttsRNA都有其对应的全长转录本，ttsRNA序列与这些转录本的开头序列以及它们对应的起始位点精确匹配。体外表达细菌的tssRNA除了RNA聚合酶全酶之外还需要其它的因子。此外，实验表明RNA聚合酶在tssRNA位点处会停驻。

研究者认为，这可能是细菌在转录过程中对转录系统的一个检验点，比如检查RNA聚合酶的装配是否正确、转录起始因子有没有丢掉、延伸因子有没有到位等。ttsRNA的存在提示了一种转录调控机制，同时也表明，通过能结合转录起始位点的小RNA对基因转录进行调控的方式在细菌中可能普遍存在。