生化与细胞所揭示YB-1调控3’剪接位点识别的重要功能

6月22日，国际学术期刊Nucleic Acids Research在线发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所惠静毅研究组题为YB-1 binds to CAUC motifs and stimulates exon inclusion by enhancing the recruitment of U2AF to weak polypyrimidine tracts的研究论文。该研究结果揭示了YB-1蛋白在调控3’剪接位点识别中的重要功能。


YB-1蛋白是一个多功能的DNA/RNA 结合蛋白，它在转录和翻译调控中均能发挥重要作用。近年来的一些报道表明，YB-1是一个剪接体相关蛋白并参与可变剪接，但是它调控剪接的分子机制并不清楚。本项研究发现，YB-1能够特异地结合含有CAUC或CACC核心序列的RNA，并证明了CAUC序列是一类新的剪接增强子。利用细胞表面吸附分子CD44基因作为模型，研究阐明YB-1通过结合CD44可变外显子5（v5）中和其上游多聚嘧啶位点中的CAUC序列促进外显子v5剪接的作用方式。U2AF65是识别3’剪接位点中多聚嘧啶区的关键剪接因子，有意思的是，U2AF65并不直接结合外显子v5上游的多聚嘧啶区。进一步的实验结果揭示了YB-1识别CAUC序列，并通过直接结合U2AF蛋白招募U2AF65到弱的多聚嘧啶区，从而激活外显子剪接的分子机制。


哺乳动物基因的3’剪接位点顺序十分不保守，大量内含子的3’剪接位点中多聚嘧啶区缺乏U2AF65结合序列，这些3’剪接位点是如何被识别的一直是大家关心的问题。本项研究提示了其它RNA结合蛋白也可能通过这一方式参与了弱的3’剪接位点的识别，相关研究正在深入开展。


该课题由博士生魏文娟和牟世荣在惠静毅研究员指导下完成，得到了科技部、国家自然科学基金委、中国科学院以及上海市科委等的经费资助。