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【求助】想问一下处理细胞做western的问题
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我现在研究的是药物阻断LPS对Macrophage细胞的毒性作用。因为Macrophage细胞是贴壁细胞,我想用western 研究LPS singalling pathway上的protein的活性变化,怎样才能拿到细胞总蛋白。是用lysis solution还是用EDTA消化呢?
另外Macrophage细胞能作Flow cytometry 吗?
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最新回复
zranqi_1 (2012-9-15 13:01:23)
我最近也在做细胞的western相关试验。以下是我总结的方法,仅供参考。
1。如果细胞是半贴壁细胞,用冷的PBS漂洗细胞2次,加PBS用枪头吹下细胞,离心去上清,加入一定体积的裂解液(PMSF临用前现加),再加2*上样 buffer煮沸10min,离心上样;
2。贴壁细胞,用冷的PBS漂洗细胞2次,加入一定体积的裂解液(PMSF临用前现加,冰上)裂解细胞数分钟,用细胞刮刮下细胞,连同裂解液和细胞碎片共同转移至离心管中,再加2*上样 buffer煮沸10min,离心上样;
另外,对于贴壁细胞,我也试过用胰酶+EDTA消化下来,再用冷的PBS漂洗细胞,再加裂解液等的方法,SDS-PAGE 及western结果并没有显著影响,总之把握一个总原则,即低温和加蛋白酶抑制剂。
多多交流!
101010 (2012-9-15 13:01:49)
另外,你一般用什么公司的antibody,我想买cell signaling 的,不知道咋样?
zranqi_1 (2012-9-15 13:02:45)
直接加裂解液的话,总体积太多了,感觉损失比较大,不知道大家有什么好办法。
我是用胰酶消化后收集细胞,然后裂解(20000个cell/微升裂解液),提总蛋白。配方是分子克隆第二版的单去污剂法,不加叠氮钠。
50mM Tris-HCl (pH8.0)
150mM NaCl
100ug/ml PMSF
1ug/ml Aprotinin
1% Triton X-100
jrwyyplt (2012-9-15 13:03:16)
无论是做Western, 还是做Flow, 我们都是先将Macrophage消化下来,再进行后面的实验。
DDD (2012-9-15 13:03:56)
101010 (2012-9-15 13:04:24)
zranqi_1 (2012-9-15 13:05:15)
Aprotinin和PMSF一样,都是蛋白酶抑制剂。
BOSS2011 (2012-9-15 13:06:14)
150 mM NaCl
50 mM Tris-HCl, pH 7.4
1 mM phenylmethylsulfonyl fluoride
1% Triton X-100
1% sodium deoxycholic acid
5 µg/ml of aprotinin
我的一抗是用的BD公司的。
HP007 (2012-9-15 13:06:36)
我将细胞消化下来后,PBS洗三次,弃液,细胞沉淀直接加2*SDS上样buffer,煮10分钟,做下来还不错,蛋白浓度较高。
windy+++ (2012-9-15 13:06:59)
对啊,我也是用上样buffer裂解细胞的,效果没问题的。
qhyu (2012-9-15 13:07:22)
此法可避免xinglinzi的用胰酶消化,造成目的蛋白的降解,收集产物也较全。
以我的研究为例,15L培养瓶(培养面积 2200Cm2)加入100ml 裂解液,手工转动10Min 以内,贴壁的Vero细胞即可全部脱落。
大家可以试试~
欢迎交流HaHa ~
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