【讨论帖】请教CO-IP的经验!

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本人做了很长时间的co-ip实验,但是一直没有什么进展,目前正在用阳性对照摸索实验条件,但是两个月了还是没有得到好的结果,实在是无奈!现在向各位请教,共讨之!
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最新回复

  • woshiduiyan (2013-8-10 11:24:54)


    外源质粒转染HeLa细胞后,提取细胞总蛋白。但是好像在提取这一步就做得不是很好,我用的裂解液成份是50mMTirs-Cl,150mM NaCl,1%NP40+Aprotinin+PMSF
  • 98776langtao (2013-8-10 11:25:13)


    0.5% Triton X-100 代替 1%NP40,
    When incubate with your Tag antibody, Please dilute Triton to 0.2% with lysis buffer not containing detergent. room temperature incubation 1h, wash with lysis buffer then move to three times washing by PBS.
    Run gel-----> Good result!
    Good luck
  • woshiduiyan (2013-8-10 11:25:35)


    不知道如果加上超声波破碎细胞,提取的蛋白含量会不会高,请问超声破碎的具体条件是怎么样?哪里能查到?
  • woshiduiyan (2013-8-10 11:26:29)

    Triton X-100的效果是不是比NP-40的要好?还有,请问你COIP具体的操作能否交流?我的跟你的有很大的差别,我想两者作一作比较。THX
  • lgm (2013-8-10 11:27:00)

    TritonX-100和NP40都可以没有太大差别。只是不知道你说的没有好结果是什么情况。
    一般情况要Preclearing和4度incubation。
    在洗的时候注意选择离子强度
  • xingyi08 (2013-8-10 11:27:19)


    不知道有谁做过用外源基因在哺乳动物细胞内表达,然后利用标签作CO-IP的,能具体交流吗?我现在的实验面临瓶颈,又急着要实验结果毕业,心急!
  • xingyi08 (2013-8-10 11:28:38)


    由于在摸索条件的阶段,所以用T+p53这对阳性对照做试验。
    T+p53两种质粒转入细胞后,48h后收获,加不同NaCl浓度的lysis buffer裂解。
    遇到的困难:
    1.提取的蛋白浓度过低。
    2.直接用总蛋白SDS—PAGE电泳后,考染发现,条带边界锯齿状,还原上样缓冲液与非还原上样缓冲液之间蛋白条带数没有差别,且上样后电泳的溴芬兰跑得特难看。
    3.用提取的蛋白CO-IP,参考的是Roche公司的操作手册,因为我们用的protei A-agarose 是Roche的;洗涤后做WB,发现目的条带若有若无,非常的弱,且实验非常不稳定,重复的两次实验之间结果都不同。后来从60mm平皿改用100mm平皿养细胞,加大细胞的量,结果都没有出来。
    转眼一个月又一个月过去,实验条件改了很多,还是毫无进展,实在是汗颜,现请各位指点一二。先谢了^_^
  • standbyme (2013-8-10 11:28:58)

    在转染阶段要保证效率,可以72小时或更长时间检测。

    我认为没必要用不同NaCl浓度的lysis buffer裂解,50mM~150mM都可以。保证裂解完全。检查抑制剂质量和正确用法。
    条带边界锯齿状是由于DNA和detergent的原因。可以超声5s或用3~5x loading buffer,或者在裂解液中加dnase.
    Replace DTT with bMe.
    不要用高于300mM的盐洗。
    检查抗体来源,注意protein A and protein G have different binding specificity. 我们只用amersham的protein G.
    还可以试不同公司的抗体,不是每一个抗体都好用 (对IP来说)。
  • DDD (2013-8-10 11:29:22)

    抑制剂的PMSF是新配的,protinin(好像是这样写的)是以前实验室分装好的小份,用一次即废弃的。
    detergent只有一种NP40,而且是1%的,对电泳的影响这么大?我破壁就是用超声,加的也是5×loading buffer,以前是用b-ME的,但是效果也不理想,所以才重新配,换成DTT。
    你所说的抗体的两个问题我都注意到了,我们是换了不同的抗体实验的。protein A的适应范围确实没有G广,但是我们的抗体都是针对A买的,问题应该不是太大,
  • standbyme (2013-8-10 11:30:30)


    你有直接细胞裂解的对照吗?western的带强吗?
    你用的是RIPA? 用得着再超生吗?
    我所说的3~5x loading buffer是指最终浓度。
    你用的抗体是什么?
  • vera+ (2013-8-10 11:30:49)


    我说一下co-ip的注意事项把:
    1,它只能研究在细胞溶胶中的蛋白质相互作用;
    2,必须有proper control;
    3,不能检测暂时的相互作用;
    4,不能检测不容的生物大分子间的相互作用;
  • zwsyrt (2013-8-10 11:31:06)


    你好jacky010:能具体介绍下这个技术吗?最近要做,可是没有人做过,不知道实验的那个环节要注意什么?
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