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【求助】pet32a到底融合蛋白有多大
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pet32a到底融合蛋白有多大,前面有his-tag,trx-tag,s-tag共有400多个氨基酸,如果这样算起来应该有40多kd,我的酶切位点前面是bamhi,后面是salI。我的目的条带全长是1200bp。高手给我指点一下吧
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字体: 小 中 大 | 打印 发表于: 2013-10-29 21:44 作者: dmg 来源: 分析测试百科网
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seagate (2013-10-29 21:44:52)
首先要确定你插入的片断C端有没有终止子,如果有,那么trx-tag、his-tag、s-tag,DDDK酶切位点等融合片断一共大约为18KD,加上你的目的蛋白400AA,融合蛋白应该为62KD左右。
dmg (2013-10-29 21:45:44)
非常感谢,那我在不到20kd和40多kd有两条目的条带,那40多kd的是不是目的条带呢?
seagate (2013-10-29 21:46:17)
如果你表达的目的融合蛋白经过纯化、EK酶切,那么20KD以下位置的条带是融合片断部分,40多KD带就是目标蛋白。
如果你做的是菌体电泳,不应该有这两条带,应该只是60KD左右带。
如果你的菌体经过破菌处理,取上清做电泳,那么可能会有融合蛋白降解形成20、40KD带。这时要考虑破菌条件,减少融合蛋白降解。
下次问问题请将条件说清楚,“不到20kd和40多kd有两条目的条带”是在什么情况下出现的。
祝表达成功!
dmg (2013-10-29 21:46:53)
seagate (2013-10-29 21:47:20)
未诱导的全菌western也能显色20KD的带我没法解释,即使是基础表达也应该是和诱后一样,只是弱一些而已。
dmg (2013-10-29 21:47:59)
在marker旁边是未诱导的全菌,其他是诱导后的。可看到在20kd、40kd有两条条带。
seagate (2013-10-29 21:48:22)
对不起,这几天没有上网。
刚看到你的图,首先你的图照反了,我只有大致猜一猜。
所谓20KD的带在我看来完全可以忽略,和你的主带相比弱多了。
marker边上的诱导前菌的两条带应该不是,可能是相邻上样孔的溢出。
你的MARKER在最边上,所以条带扭曲,对应目标蛋白条带在你所说的40KD应该比这大,我认为就是融合蛋白60KD的带。
把你的电泳图也发上来看一看,别反了。
dmg (2013-10-29 21:48:54)
biabiade (2013-10-29 21:50:04)
顺便问一下,肠激酶酶切下的融合蛋白有多大?我的表达蛋白113aa,没有抗体,能分离出来吗?
ns5fan (2013-10-29 21:50:25)
肠激酶酶切下的融合蛋白对pET32来说应该有17-18k左右,但我在查看文献和自己实验中发现条带在14k左右,原因不明!?!?阿
bling (2013-10-29 21:50:58)
是啊 ,有trx-tag,s-tag,his-tag,dddk,共130多个aa,分子量应该在18kd左右。我的表达蛋白113aa,差不多13、4kd,怎么分离二者呢?高手指点啊!
dreaming (2013-10-29 21:51:21)
PET32载体的空白蛋白应该有26KD的样子,融合后的蛋白不一定是简单的相加,可能会略有差别。
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