【讨论帖】】Tricine-SDS-PAGE胶的使用方法与心得


先说一下Tricine胶的好处。
Tricine胶比较容易将样品压平,具体原因我也没有搞清楚,但可以肯定的是这种胶跑出来的Marker又细又直,同样,显出来的条带也压的很好。与普通的SDS-PAGE胶跑出来的结果相比,Marker扩散没有那么厉害,各泳道条带间隔明显,不像普通胶的条带容易连到一起。反正跑出来的条带就是很漂亮。

Tricine-SDS-PAGE胶的配方:(我一直用的就是10%这个浓度,把8KD和280KD都做出来了)
分离胶 积层胶
ddH2O 1.85 mL 2 mL
AB-3 1 mL 250 uL
Gel-Buffer(3*) 1.65 mL 750 uL
甘油 0.5 mL —
10%AP 25 uL 22.5 uL
TEMED 2.5 uL 2.25 uL
(这个配方来自DXY,今天又回来了,呵呵)

3*Gel-Buffer 配方:(200mL量)
Tris-Base 48.44g
Tris-HCl 31.52g
SDS 0.6 g
pH 8.45,很难溶,可以60°C水浴促进溶解。

AB-3 (100mL量)
丙烯 48g
双叉丙烯酰胺 1.5g
注意:丙烯溶解后会使溶液体积增大,故只要用约80mL水溶解即可,完全溶解后再定容。通风橱内操作,注意保护自己!

外槽电泳液(+极)(Anode Buffer)10*
Tris-Base 46.92g
Tris-HCl 17.73g
500mL体积,pH 8.9。

内槽电泳液(-极)(Cathode Buffer)10*
Tris-Base 24.22g
Tricine 35.84g
SDS 2g
200mL体积,pH 约8.25。

(内外槽电泳液的体积这样配,是因为一般电泳槽内槽一次只要150mL液体,而外槽需要400-500mL液体。)

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最新回复

  • ukonptp (2013-11-19 15:59:14)

    QUOTE:

    原帖由 梦幻苹果 于 2013-11-19 15:58 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')

    先说一下Tricine胶的好处。
    Tricine胶比较容易将样品压平,具体原因我也没有搞清楚,但可以肯定的是这种胶跑出来的Marker又细又直,同样,显出来的条带也压的很好。与普通的SDS-PAGE胶跑出来的结果相比,Marker扩散没有那么厉 ...
    制胶配方中的Tris base是tricine,不是Tris
  • ukonptp (2013-11-19 16:06:51)

    制胶时,分离胶做好后加水压平,一般20min就凝固了。
    这里有个技巧,已经在某个帖子里回答别人了。为了避免样品漏的问题,可在分离胶凝固后(表现为分层处出现一条清晰的分界线),这时候,可以不急着把水控干,而是配置积层胶,但是AP和TEMED先不加,再空出水(枪头沿一边吸尽即可),再在积层胶里加入AP,TEMED,迅速混匀,先取少量胶液灌入板内,轻轻摇晃几下,润一遍,弃掉这些胶液,这时候尽量去干净,动作要快。再正式灌满胶液,插上梳齿。

    跑电泳时,可以60V先压约30min,可以看到溴酚蓝变的又细又直,待进入分离胶,可以看到预染的Marker已经分离,就可以将电压调至120V跑完。

    转膜与普通的都一样,这里建议30V恒压转2小时(用于80KD以下的蛋白分子),如果有更大的蛋白280KD的mTor,可以再这2h后再加350mA 30min,效果很好,280KD以下90KD以上的都可以加350mA这一步,时间根据分子量来定。90KD加15min即可。

    先写这些吧,有什么问题我们再讨论。希望对大家的实验有所帮助。
  • wood533 (2013-11-19 16:07:31)


    我想请教一下楼主Tris-Base和Tris-HCl有什么区别?还有就是Tricine-SDS-PAGE系统不是应该有3层胶吗?
    小弟最近正在做一个6K分子量小蛋白的western-blot,可用普通的sds-page电泳后所得到的压片条带不是很理想,希望楼主给予帮助,非常感谢。
  • redbutterfly (2013-11-19 16:08:06)


    你6K分子量小蛋白的western-blot能做出来?能把你方法说说吗?我在做7.5的,普通的sds-page电泳,啥也没有?非常感谢啊!园里说Tricine-SDS-PAGE系统3层胶适合5K以下蛋白。
  • 梦幻苹果 (2013-11-19 16:09:23)


    6KD的蛋白我没做过,但是应该可以。如果要用孔径更小的膜效果会更好一些
    这个系统是很稳定的。
  • 梦幻苹果 (2013-11-19 16:09:48)

    Tris-Base就是Tris碱,Tris-HCl就是Tris盐酸。
    做普通胶不是有PH6.8和8.8的Tris-Hcl吗?配置时好像就是用Tris-base加酸调的PH值就可以了
    TAKARA参考书上有这个配方。
    我们这个系统里用的Tris-Base和Tris-HCl就是两种不同的粉剂。
    3层胶我还没做过,因为这个蛋白分离范围已经很大了,足够了。
  • kuohao17 (2013-11-19 16:10:28)


    多谢楼主回复了。
    另回复楼上的问题,我做6kd的蛋白用的是普通的sds-page,分离用的是20%的胶,之所以不满意是因为电泳条带有些弥散,最后压片的结果不是很好看,所以想尝试Tricine-SDS-PAGE。至于电泳条件是恒流11mA 30min,随后15mA 1小时,具体情况可参考预染marker,感觉这个条件和楼主的恒压情况可以基本对应,小分子蛋白又是做western-blot不宜跑得太久。转膜我用的是湿转,20V 1.5-2小时(起始电流大概130mA左右),和楼主的条件也差不多。电泳仪可能比较老了,貌似还是Pharmacia的。
  • qiangren789 (2013-11-19 16:11:10)


    楼主,大约17KD左右的蛋白,用0.45um的膜来转会不会转过啊?
  • flower-201 (2013-11-19 16:11:34)

    请问小分子量的对照物(肌球蛋白F1\F2\F3)在哪可以买到?价格怎么样?
  • luoliqiong (2013-11-19 16:12:12)


    Tris:三羟甲基氨基甲烷,
    分子式:(HOCH2)3CNH2
    结构式:


    78718035.png

  • luoliqiong (2013-11-19 16:12:36)


    Tricine:三羟甲基甲基甘氨酸
    分子式:C6H13NO5
    结构式:


    54456087.gif

  • 梦幻苹果 (2013-11-19 16:13:16)

    对于这个错误给大家道歉!
    我的整个体系是从师姐的实验记录本中摘抄下来的,有了出入,我已查阅相关文献,证实版主skykiller是对的。
  • yonger (2013-11-19 16:13:49)


    昨天做了tricine SDS_PAGE,没有AB-3,就用的Bio-Rad的30%的stock solutions,调整了一下用量.
    Anode buffer: 0.2 M Tris-HCl, pH8.9
    Cathode buffer: 0.1 M Tris, 0.1 M Tricine, 0.1% SDS, pH8.25
    Gel buffer: 3.0 M Tris, 0.3% SDS, pH 8.45
    Electrophoresis: 80V 30min, 200V 60min.
    结果小分子量的条带很弥散,不只是什么原因?请楼主和高手指点迷津。图片做的不好,让大家见笑了。谢谢!
       10% 分离胶   4% 积层胶
    DDH2O   2.3 ml   3.36 ml
    Gel buffer   3.3 ml   1.2 ml
    AB ( 30% stock)   3.34 ml   0.67 ml
    Glycerol(100%)   1 ml   0 ml
    10% APS   50 μl   40 μl
    TEMED   6 ul   5 ul
  • 梦幻苹果 (2013-11-19 16:14:19)


    第四道似乎漏了。
    小分子量的条带本身就会弥散。
    你仔细观察就会发现,分子量越大条带越细,分子量越小越弥散,表现出的就是条带很粗。
  • windy+++ (2013-11-19 16:14:49)

    你的甘油是纯的?会不会很难吸起来啊!这样会不会不准,能问下你的丙烯酰胺是百分之几的啊!你的浓缩胶和分离胶Gel-Buffer的PH值是一样的啊?
  • qhyu (2013-11-19 16:15:47)


    LZ,按照你的配方,我制的浓缩胶根本不凝固,电泳完了,转膜时发现浓缩胶就跟浆糊似的,什么情况呢?你的配方没问题吧?
  • 梦幻苹果 (2013-11-19 16:16:22)


    浓缩胶不凝 是不是AP不行啊 AP粉剂很容易吸潮 时间久了就失效了 还有温度低了会影响凝固的
    可以把10%AP和TEMED的量加大 会凝的快些
    上面的配方是按我实验记录本录上来的
  • 梦幻苹果 (2013-11-19 16:17:20)


    还有 至于版主的留言问题
    我想说的是 只有负极缓冲液用了tricine
    我一直用的是上面的配方 tris-base 和tris-HCl都写的很清楚 没有错的