【求助】95kb蛋白WB有Marker没目的条带


 电泳:marker跑的很漂亮,平齐,散开。

 转膜:用的0.22的膜,电流原来用100MA,2h,没有条带,marker明显。

             电流用300MA,90min,结果一样,也没条带!

 一抗4°过夜。二抗是红外二抗,湿转。

 背景很淡,就是没条带。

 胶做过考马斯染色,条带也是很清晰。

我个人觉得:1.蛋白有问题?

      2.转膜问题最大?

      3.膜应换成0.45?

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最新回复

  • junhun (2013-12-02 17:05:43)


    我建议你先跑一下蛋白胶看看,是否有你的目的蛋白。
    同时,在做WB时,跑两块胶,一块用来检测上样没有问题。另一块继续做下去。最后的结果就知道到底是哪个阶段出问题了。再根据情况来找原因。
  • greenbee (2013-12-02 17:06:06)


    问题出在膜上,0.22的膜只用于20KD以下的蛋白。否则都是用0.45的膜。另外,电流是不超过0.85mA/cm2,半干转不超过2h。
  • redbutterfly (2013-12-02 17:06:46)

    QUOTE:

    原帖由 greenbee 于 2013-12-2 17:06 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')

    问题出在膜上,0.22的膜只用于20KD以下的蛋白。否则都是用0.45的膜。另外,电流是不超过0.85mA/cm2,半干转不超过2h。
    错。。022膜比0.45的膜截留的蛋白更多,包括你的95KD的蛋白。

    几点意见仅供参考和排除

    1)抗体质量如何?--换另外公司抗体试一下

    2)目的蛋白是否存在细胞特异性表达?--换几种不同细胞试一下

    3)蛋白提取问题?--是否对照例如actin,出条带

    4)转膜问题?丽春红染一下
  • 89tongzijun (2013-12-02 17:07:15)

    QUOTE:

    原帖由 redbutterfly 于 2013-12-2 17:06 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')


    错。。022膜比0.45的膜截留的蛋白更多,包括你的95KD的蛋白。

    几点意见仅供参考和排除

    1)抗体质量如何?--换另外公司抗体试一下

    2)目的蛋白是否存在细胞特异性表达?--换几种不同细胞试一下

    3)蛋白提取问题?--是否对照例 ...
    1.抗体是用的进口抗体,单抗或者多抗,封闭时是否不同,我拿的牛奶封闭的。

    2.我提取的是组织的蛋白

    3.我跑了两块胶,一块考马斯染色,条带很漂亮,脱色后很清晰,另一块接着孵抗体,什么也没。

    4.我的内参是actin,买了,但是还没做。

    5.我想知道转膜条件有什么需要改善的吗?
  • redbutterfly (2013-12-02 17:07:45)

    QUOTE:

    原帖由 89tongzijun 于 2013-12-2 17:07 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')



    1.抗体是用的进口抗体,单抗或者多抗,封闭时是否不同,我拿的牛奶封闭的。

    2.我提取的是组织的蛋白

    3.我跑了两块胶,一块考马斯染色,条带很漂亮,脱色后很清晰,另一块接着孵抗体,什么也没。

    4.我的内参是actin,买了,但是还没 ...
    由于你的考马成功,说明是从砖模开始的步骤之后又问题,砖模是否成功,一个简单的立春红染色就能区分好坏。如果进一步actin以及其他内参能够检测条带,说明你的抗体有问题或者该蛋白不在该组织表达。进一步可以在其他文献已经报道的阳性细胞或组织中检测,若仍然你的抗体不工作,说明该抗体有问题。95KD的蛋白属于很好检测的分子量范围。相比细胞,组织蛋白的提取容易降解。

    从你目前提供的信息看,只能分析到此,你需要提供进一步的验证试验。更为简单的办法是,让有经验的实验室同行帮你做一次,就能判断是操作还是抗体带来的问题。

    祝好运。
  • 89tongzijun (2013-12-02 17:08:12)

    QUOTE:

    原帖由 redbutterfly 于 2013-12-2 17:07 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')


    由于你的考马成功,说明是从砖模开始的步骤之后又问题,砖模是否成功,一个简单的立春红染色就能区分好坏。如果进一步actin以及其他内参能够检测条带,说明你的抗体有问题或者该蛋白不在该组织表达。进一步可以在其他文献 ...
    我转膜后,那转膜后的胶考马斯然后,什么也没有。组织蛋白保存条件怎么样比较好呢?
  • redbutterfly (2013-12-02 17:08:35)

    QUOTE:

    原帖由 89tongzijun 于 2013-12-2 17:08 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')


    我转膜后,那转膜后的胶考马斯然后,什么也没有。组织蛋白保存条件怎么样比较好呢?
    如果两块胶是同时做的,而且转膜后的那块胶又进行靠马染色,染色显示没有蛋白,表明胶上的转过去了,是否过度转,穿过了膜的可能性有,不大,因为你给的转磨条件够用。总之一句化,简单点需要完成两件事,一个是检测内对照,然后看看丽春红染色。。若两者都没有问题,就是抗体问题,那个公司的抗体,不要告诉我是santa cruz的?是否提高了抗体的浓度?总之你看到的这个现象是一次结果还是多次试验?如果是一次,那不确定的因素更多。另外你做wb的经验多吗?我的意思是是否有检测其他蛋白成功的经历。在我看来WB的关键就是抗体的质量。

    我的组织蛋白直接冻在-20度,很长时间-80度。。
  • duoduo (2013-12-02 17:09:28)


    我认为你可以用预染Marker一起来跑胶,这样在你转膜过程结束后,可以看胶上是否残留有预染Marker。若预染Marker已经转到膜上了,则胶残留很少的或者没有Marker了。这时你可以在膜上看到Marker。这样能够验证你转膜的条件是否合适,并根据转膜后观察到的结果来调整转膜参数。

    至于你的抗体,我认为目前并不认为它有问题,毕竟商品化的东西,出问题的很少,除非你买来后,处置方面造成抗体出问题。

    至于组织蛋白的保存条件,我认为,若你新提取的,直接拿来做WB就可以了,不用过于担心这方面问题。若蛋白提取出来,马上就不能用了,或者太过于娇气,需要多么复杂的条件来保存,那么做实验已经没有意义了。这样做出来的实验,结果经常会很不稳定。

    换个人做或者让有经验的人用你现在的试剂做一下,我想也可能会发现你具体实验中的小问题。

    至于膜的问题,我认为0.22微米的膜确实能留下更多的蛋白,分子量更大的蛋白。
  • wood533 (2013-12-02 17:10:27)


    我认为可能是上样的蛋白含量有些低,你上100微克每孔试试。MARKER转的好,说明相应的目的蛋白也应该差不多,蛋白应该存在问题,你不行重新体蛋白,用新提的上样试一下。
  • wmp1234 (2013-12-02 17:11:11)

    1.抗体是用的进口抗体,单抗或者多抗,封闭时是否不同,我拿的牛奶封闭的。

    2.我提取的是组织的蛋白

    3.我跑了两块胶,一块考马斯染色,条带很漂亮,脱色后很清晰,另一块接着孵抗体,什么也没。

    4.我的内参是actin,买了,但是还没做。

    5.我想知道转膜条件有什么需要改善的吗?

    ========================================================================================================

    小小建议:

    1.你封闭液的浓度是多少?如果是磷酸化的抗体,可以用3%BSA封闭试试。一般的可以用5%的脱脂奶粉封闭1个小时。

    2.组织蛋白提取应该没问题,蛋白定量后可以增加上样量。

    3.优化WB各个步骤后还是不出,很有可能是抗体的问题。Abcam的抗体还有遭投诉的呢(周围一起做实验的好几个人订的不出结果,后来投诉之后退货的),也别太迷信进口抗体。

    4.做个actin吧,一般很好出。

    5.我们实验室一般半干恒流转,按面积*0.8,时间根据分子量大小,一般我做的130kDa的转2个小时,70,80的转90分钟,转得还OK吧!

    仅供参考!呵呵!
  • 33号 (2013-12-02 17:11:31)


    硕士时经常做WB实验,确实很郁闷 ,有时候找了好久也找不到解决办法,说说自己的心得呵:

    1、胶做过考马斯染色,条带也是很清晰-----这说明你的组织蛋白没有问题,前面的问题就可以排除了,主要是转膜和孵育的问题;
    2、95KD的蛋白属于很常用的蛋白分子量,对于这种分子量稍大的蛋白,一般我用0.45的膜半干转膜,时间为1h10min,电压为膜面积的2.5-3倍;分析楼主,可以用立春红检验下蛋白是否转膜转过去了,以便排除转膜的问题;

    3、最好用已经确定无误的阴极,阳极液,这个也很重要,曾经我就出现了这种问题;

    4、相对来说3%-5%的脱脂奶粉封闭1h效果不错(个人观点);

    5、仔细阅读抗体说明书,有时候抗体只能用BSA或是奶粉的一种来稀释;

    还是得慢慢摸索,别人说的只是参考,希望你能早日找到症结所在,实验顺利啊!!
  • hustwb (2013-12-02 17:12:29)


    我做的是94kb大小的目的蛋白,用的是250MA,90MIN,跑出来的还可以,就是有杂带,你可以试试这个条件~
  • hustwb (2013-12-02 17:13:16)


    1:用BSA封闭试试,我原来做过比较,用5%的脱脂奶粉封闭比用BSA背景干净,但也会使量少的蛋白不能显色,所以我会在寻求表达的时候用BSA,要背景干净结果好时用脱脂奶粉

    2:丽春红染色可以证明你转膜是否成功

    3:做了简单的ELISA证明你的抗体没问题