A description of how the biological reliability of measurements was validated using
biological replicates, statistical methods, independent experiments, etc.
Studies based on a single biological experiment are generally not
acceptable (except as a dataset to test bioinformatic systems). If a biological replicate from the same s
ource cannot be performed (e.g. patient sample), a large enough number
of similar biological samples, appropriately justified, must be performed
最新回复
guagua (2013-12-09 15:46:13)
我记得有看ABI公司的说明有说iTRAQ的定量非常准确，超过5%的变异即可检测出来，这样的话，就是说理论上，通过iTRAQ检测出来的大于5%的差异就算是差异了，而不像双向电泳那样需要1.5倍（50%）或者2倍（100%）以上才算差异。但是iTRAQ具体要多少才算差异，我觉得在5%的下限基础上你自己选择即可，另外，以前也有看过做双向电泳的，只要三次生物学重复的T测验小于0.05，就算差异，变化倍数是多少都要。所以，我觉得这个差异是一个个人经验决定的，没有一个完全的标准，有的也就是经验标准而已！
daod (2013-12-09 15:47:32)
另外你提到的“只要三次生物学重复的T测验小于0.05” 这个怎么计算呢？检验变量具体是什么？
guagua (2013-12-09 15:50:24)
相关疾病：
电击伤
就是采用T检验的方式，观察两组样品之间差异是否显著，可以在excel表格上进行计算，输入“=Ttest(A1-C1,D1-F1,2,2)”点击确认即可，其中A1-C1和D1-F1是你的对照和处理的三组数据！不明白的话短信息交流！
daod (2013-12-09 15:51:45)
谢谢 不过觉得3 例数少了
呵呵 不知满足统计学要求不
guagua (2013-12-09 15:52:58)
做动物的往往动物个体之间存在的差异较大，所以常采用更多个体，而做植物的，由于基因型的完全一致并且大部分都是纯合的以及培养条件以及处理条件的可控性比较强，可以达到较好的一致性，所以一般三次就够了，呵呵！
JK.jon (2013-12-09 15:53:57)
呵呵 不知满足统计学要求不
===============================================================================================================
哈哈，2-D的工作量是很大的，而且重复起来也不轻松，所以说能够有3次的生物学重复就很了不起了。现在看很多蛋白质组学的相关文章，都说是3次生物学重复，不过个人感觉这里面值得推敲，其中有相当部分可能只是三次实验重复。
taoshengyijiu (2013-12-09 15:54:35)
QUOTE:
严格讲蛋白质组学实验应该要至少3次生物学重复的，不过确实目前很多文献在这方面值得推敲。但对于有些样品，这个不是强求，但需要其他的形式来补充。A description of how the biological reliability of measurements was validated using
biological replicates, statistical methods, independent experiments, etc.
Studies based on a single biological experiment are generally not
acceptable (except as a dataset to test bioinformatic systems). If a biological replicate from the same s
ource cannot be performed (e.g. patient sample), a large enough number
of similar biological samples, appropriately justified, must be performed
in order to enable sound conclusions.
【求助】iTRAQ标记定量--认为有差异一般是什么样的标准呢？