【求助】蛋白电泳怪现象

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【求助】蛋白电泳怪现象

最近跑SDS-PAGE,用碧云天RIPA裂解细胞,六孔板每孔100微升。并添加PMSF和Cocktail .冰上裂解1小时,加入5倍上样buffer后,煮沸5min.上样。80v跑浓缩胶,100v跑分离胶。结果却是这个样子。20kD以下的蛋白很少。并且拖带弥散。请问各位这是什么原因?
谢谢
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最新回复

  • whitesheep (2013-12-14 17:09:34)


    我的蛋白正好在20kD处,这个样子的话,根本看不到目的条带 。郁闷中。。。
  • 12xunmei (2013-12-14 17:09:55)


    先给你说一下我的步骤吧,
    1。动物组织剪碎,PBS洗两遍
    2 碧云天RIPA细胞裂解液,与PMSF100:1混合,
    3 冰上裂解40分钟(每15分钟剧烈震荡一次)
    4 4度12000转离心15分钟,
    5 BCA测蛋白浓度(最好是测一下,这样会有个大概的上样量)
    6 蛋白变性 蛋白:buffer=3:1(加入5倍的上样buffer我认为是不正确的),95度10分钟 (我的习惯是把所有的蛋白一次变性然后放-20备用,因为害怕蛋白降解)
    7 12.5%胶(这个应该根据蛋白的分子量定,不过我们实验室30KD一下的也用这个浓度的胶 做出来了)
    8 预电泳 恒压80v 30分钟
    9 上样 浓缩80v <20分钟,分离100v <90分钟(这要根据分子量定电压)
    我认为从你给出的步骤可能有几个原因:1 蛋白上样量太大(看图感觉可能性不大)
    2 buffer量太大,蛋白稀释太多(这个可能性较大)
    3 胶出现问题:浓度不合适,或配胶用的液体不合适
  • 12xunmei (2013-12-14 17:10:20)


    配胶的液体不合适意思就是有的液体要避光,有的要在一定时间内用完,有的要求调PH值,有的要避光,过会就给你液体配方,这只是我自己的意见。
  • 12xunmei (2013-12-14 17:10:38)


    WB 液体配方
    A液: 29.2g丙烯酰胺、 0.8g甲叉双丙烯酰胺,一级水(三蒸水)定容至100ml,完全溶解后 0.45微米滤器过滤,4度避光保存(1个月)
    B液: 18.15gTris加适量一级水溶解,用盐酸调PH值至8.8,一级水定容至100ml,4度保存
    C液: 6.05gTris加适量一级水溶解,盐酸调PH值至6.8,一级水定容至100ml,4度保存
    D液: 10gSDS,90ml一级水溶解后,定容至100ml,室温保存。
    E液: 10ml TEMED,加一级水100ml,4度避光保存
    F液: 0.1gAPS,一级水溶解至1ml,4度保存(1周内用完)
    备注: A、B、C液建议都用0.45微米的滤器过滤。
  • langlang (2013-12-14 17:11:01)


    以前也跑出过这样的一板胶,当时自己将其命名为“哭笑不得”。

    蛋白条带“哭笑不得”产生的原因:
    上样量过大,或者电泳时电压(电流)过大能让蛋白条带微笑;而SDS胶制备的不好(各成分未充分混匀,胶凝固时间不够等)多半会让蛋白条带哭泣;如果上述原因共存,那蛋白条带只好哭笑不得了。

    另外,我猜想你没有做蛋白定量(仅限于该电泳结果哈),建议还是测一下样品蛋白浓度,然后将各样品调整到统一的浓度,再加入上样buffer变性。这样能保证相同的上样体积和蛋白量。
  • greenbee (2013-12-14 17:11:36)


    顶!
    最近也被同样的问题所困扰,尝试过很多方法:如减少上样量、减小电压、让胶的凝固时间延长。但仍无任何改善。
    非常希望强人能一针见血的指出关键因素在哪里。
    泣血求,万分感谢!!!
  • uaubc (2013-12-14 17:11:58)


    我可以肯定的告诉你:把你的所有制胶溶液全重新配,然后调整上样量,100ul 碧云天的细胞裂解液,裂解1*10^6个细胞,上样量10ul,条带肯定清晰。但是,问题是:
    我跟你做的东西是差不多的,虽然我的条带很清晰,但是,20kDa以下的蛋白,条带越来越暗,像弥散一样,这个问题,我还没有解决。。。
    我现在去发帖,请楼主关注我的求助贴,期待高人出现。
  • tangxin_80 (2013-12-14 17:12:22)


    1,建议提高胶的浓度试试看(15%)
    2,裂解好的蛋白用pbs稀释一定倍数,和终浓度1*上样液混合变性后,高速离心5min,然后点上清,降低裂解液成分的影响。
  • uaubc (2013-12-14 17:13:00)


    提高胶浓度无济于事,因为他的Marker都跑成那样。
    你的问题就是:电泳的制胶溶液很陈旧了,懒得更换新的。你换成新的,我保证你跑出漂亮的图。
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