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【求助0】蛋白不表达
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发表于: 2013-12-18 17:39 作者: 30moonriver 来源: 分析测试百科网
查看完整版本请点击这里:
【求助0】蛋白不表达
本人初做原核表达,不知道哪里出了问题,目的蛋白未能表达,请各位帮我分析一下原因,谢谢!目的蛋白是一种抗菌肽,表达载体PGEX-3X,菌种为BL21,IPTG终浓度为1mM,诱导温度37ºC,诱导时间4h。
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【求助0】蛋白不表达
我也来说两句
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xingyi08
(2013-12-18 17:40:12)
先看看构建的质粒有没有问题嘛。
30moonriver
(2013-12-18 17:40:35)
在诱导之前抽过质粒,PCR检测有目的条带,但是未见目的蛋白表达
wmp1234
(2013-12-18 17:40:58)
质粒有没有经过酶切验证和测序验证
cwcwcww
(2013-12-18 17:41:18)
可以从一下几个方面去总结分析一下:
1:确认你的目的片段成功插入至表达载体中,而且其插入顺序没有问题,不存在突变,是否包含有完整的启动子或是终止子序列。而且确认转入至合适的表达宿主。
2:成功构建表达元件后进行诱导表达的实验,在没有成熟的诱导表达体系之前都需要自己去摸索:诱导剂的浓度,诱导时间,诱导温度等等。同时注意实验操作过程的小问题,比如抗性的选择等等。。。
3:产物的收集和浓缩。在检测目的蛋白是否表达首先要分析产物是在胞外还是胞内,目的蛋白的特性等等,以免在浓缩之前目的蛋白受到损失或破坏。
4:运用多种检测方法的检测。每种检测方法的灵妙度不同,具体的蛋白检测方法根据实验室或是个人需求选择。终极目标就是准确就好。
。。。。
认真分析总会有结果的,祝实验顺利!
30moonriver
(2013-12-18 17:41:42)
补充一下,用特异性引物从cDNA中PCR获得目的片段,TA克隆后,PCR能检测到明显的目的条带
质粒经bglII和EcorI酶切后获得具有粘性末端的目的片段,用BamHI和EcorI双酶切PGEX-3X,其中BamHI和bglII是同尾酶,连接转化后,奇怪的是,获得的质粒的PCR结果中除了明显的目的条带之外,在其上方还有一条同样很明显的条带,(不知道是不是发生了突变?)
将空质粒做了PCR,但并未检测到任何条带,因为目的条带比较明显,所以试着往下做,但SDS-PAGE检测结果并没有看到明显的目的条带
诱导后的菌液经离心后,加入水和loading buffer煮沸5-10min,直接电泳检测,这样做有问题吗?
正在尝试改变诱导时间、温度和浓度等实验条件,由于问题比较多,是不是需要重新从头开始做?希望各位前辈提出宝贵的意见!谢谢
yjf1026
(2013-12-18 17:42:10)
质粒有没有经过酶切验证和测序验证
================================================
一定要做酶切和测序验证的,电泳又看不出来有没有突变。
cwcwcww
(2013-12-18 17:42:32)
可能问题:
1:如以上战友提到的,你的序列最好经过测序验证(完整测通的),避免因PCR引进突变(毕竟再保真的酶都有错配的可能)。
2:进行PCR验证的时候,对于同一模板而言的话,有突变基本不影响片段大小的。所以楼主当中的非特异扩增在验证不是质粒部分后,就有可能是你的模板出现问题,特别对于质粒抽提当中的基因组的少量污染。当然这些都要保证你的其他体系没有问题(来个不加模板的阴性对照)。
3:诱导的东西先不说,在你收集菌体后的处理方式,楼主可以考虑进行5M的尿素和loading buffer煮沸10分钟的方式,确保目的蛋白的释放,此方供参考。
4:确认问题后楼主就知道试验还有没有重复的必要了。。。
记住,实验就是重复加不断的重复,而又不是无谓的重复!
祝你好运!
ffaa
(2013-12-18 17:42:52)
请教:抗菌肽能用E.coli表达?产生的抗菌肽不会对你的BL21的生长产生抑制?
30moonriver
(2013-12-18 17:43:09)
我用的表达载体是pgex-3x,载体上的GST连着目的蛋白,影响其空间构象,可以消除对细菌生长的抑制。
greenbee
(2013-12-18 17:43:33)
GST一般不会影响折叠的。可以尝试18C过夜表达,还可以试一下加1%葡萄糖,IPTG 0.4mM足够了,还有种子液的浓度,诱导时的OD值都应该注意
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xingyi08 (2013-12-18 17:40:12)
先看看构建的质粒有没有问题嘛。
30moonriver (2013-12-18 17:40:35)
在诱导之前抽过质粒,PCR检测有目的条带,但是未见目的蛋白表达
wmp1234 (2013-12-18 17:40:58)
质粒有没有经过酶切验证和测序验证
cwcwcww (2013-12-18 17:41:18)
可以从一下几个方面去总结分析一下:
1:确认你的目的片段成功插入至表达载体中,而且其插入顺序没有问题,不存在突变,是否包含有完整的启动子或是终止子序列。而且确认转入至合适的表达宿主。
2:成功构建表达元件后进行诱导表达的实验,在没有成熟的诱导表达体系之前都需要自己去摸索:诱导剂的浓度,诱导时间,诱导温度等等。同时注意实验操作过程的小问题,比如抗性的选择等等。。。
3:产物的收集和浓缩。在检测目的蛋白是否表达首先要分析产物是在胞外还是胞内,目的蛋白的特性等等,以免在浓缩之前目的蛋白受到损失或破坏。
4:运用多种检测方法的检测。每种检测方法的灵妙度不同,具体的蛋白检测方法根据实验室或是个人需求选择。终极目标就是准确就好。
。。。。
认真分析总会有结果的,祝实验顺利!
30moonriver (2013-12-18 17:41:42)
质粒经bglII和EcorI酶切后获得具有粘性末端的目的片段,用BamHI和EcorI双酶切PGEX-3X,其中BamHI和bglII是同尾酶,连接转化后,奇怪的是,获得的质粒的PCR结果中除了明显的目的条带之外,在其上方还有一条同样很明显的条带,(不知道是不是发生了突变?)
将空质粒做了PCR,但并未检测到任何条带,因为目的条带比较明显,所以试着往下做,但SDS-PAGE检测结果并没有看到明显的目的条带
诱导后的菌液经离心后,加入水和loading buffer煮沸5-10min,直接电泳检测,这样做有问题吗?
正在尝试改变诱导时间、温度和浓度等实验条件,由于问题比较多,是不是需要重新从头开始做?希望各位前辈提出宝贵的意见!谢谢
yjf1026 (2013-12-18 17:42:10)
================================================
一定要做酶切和测序验证的,电泳又看不出来有没有突变。
cwcwcww (2013-12-18 17:42:32)
可能问题:
1:如以上战友提到的,你的序列最好经过测序验证(完整测通的),避免因PCR引进突变(毕竟再保真的酶都有错配的可能)。
2:进行PCR验证的时候,对于同一模板而言的话,有突变基本不影响片段大小的。所以楼主当中的非特异扩增在验证不是质粒部分后,就有可能是你的模板出现问题,特别对于质粒抽提当中的基因组的少量污染。当然这些都要保证你的其他体系没有问题(来个不加模板的阴性对照)。
3:诱导的东西先不说,在你收集菌体后的处理方式,楼主可以考虑进行5M的尿素和loading buffer煮沸10分钟的方式,确保目的蛋白的释放,此方供参考。
4:确认问题后楼主就知道试验还有没有重复的必要了。。。
记住,实验就是重复加不断的重复,而又不是无谓的重复!
祝你好运!
ffaa (2013-12-18 17:42:52)
请教:抗菌肽能用E.coli表达?产生的抗菌肽不会对你的BL21的生长产生抑制?
30moonriver (2013-12-18 17:43:09)
我用的表达载体是pgex-3x,载体上的GST连着目的蛋白,影响其空间构象,可以消除对细菌生长的抑制。
greenbee (2013-12-18 17:43:33)
GST一般不会影响折叠的。可以尝试18C过夜表达,还可以试一下加1%葡萄糖,IPTG 0.4mM足够了,还有种子液的浓度,诱导时的OD值都应该注意
【求助0】蛋白不表达