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我做转基因原核表达,测序正确,一个反应就测完了,但是表达出来的蛋白比预测的大了3-4kd.不知道怎么会出现这种情况啊??? 而且我的蛋白是前端融合his标签表达的,wb做了有条带。 分子marker 从上而下是 94kd, 60kd, 45kd, 27kd, 18kd, 第一道是空载体阴性对照, 第二道是目标蛋白,预测是16.7kd, 第三道目标蛋白,预测是23.8kd
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最新回复

  • gogo (2013-12-20 16:17:16)

    QUOTE:

    原帖由 11_hjx 于 2013-12-20 16:16 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')

    我做转基因原核表达,测序正确,一个反应就测完了,但是表达出来的蛋白比预测的大了3-4kd.不知道怎么会出现这种情况啊??? 而且我的蛋白是前端融合his标签表达的,wb做了有条带。 分子marker 从上而下是 94kd, 60kd, 45kd, 27kd ...
    不会是可变剪切吧?
  • dmg (2013-12-20 16:17:40)


    histag重组蛋白在做SDS-PAGE时,其表观分子量有时候偏大,这与带正电荷的histag在电场中的反向作用力有关,不一定是构建的序列不正确。
    版内讨论过此类问题,有一篇文献还专门讲过这个问题,请搜索一下吧。
  • NBA (2013-12-20 16:18:10)


    3-4 kD out of 24 kD is fully acceptable.
  • ero11 (2013-12-20 16:21:19)


    从6HIS到你设计的酶切位点之间的序列你算进去了吗?
  • 阿司匹林 (2013-12-20 16:22:20)


    同意4楼,SDS-PAGE本来就不准,你从氨基酸序列推出来的分子量也不准,所以这个误差应该是可以接受的。
    如果有目的蛋白的纯品做阳性对照会更容易分析。
  • hold住 (2013-12-20 16:22:42)


    只差3-4KD很有可能就是对的了,有的marker会不很准确,而且根据marker估算目的条带也会有误差,所以你可以接着往下做一下看看功能怎样了
  • one (2013-12-20 16:23:09)

    楼上的是正解,本人做his-tag蛋白时也经常遇到同样的情况。若想确定就做一个目的蛋白抗体的western-blot,用空载体菌株的总蛋白做阴性对照。
  • zsxan1990 (2013-12-20 16:36:26)


    你是不是根据marker目测分子量,这样肯定会有误差的,再说Marker的个个条带在不同浓度的胶上的迁移速度是不同的,不能按距离等分。Good Luck!
  • 98776langtao (2013-12-20 16:37:15)

    大几KD是正常的,可以做一下WB,鉴定是不是你要的蛋白质!
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