【求助】Western-blot的条带高高低低,怎么回事?


这几个条带本来应该是在同一marker水平的,为什么我作出来会是这样有高有低的呢?
我用5%浓缩胶,12%分离胶,(不好意思之前写反了)分子量55KDa,电压为50v和110v
蛋白上样量每孔都相同的。
是因为胶没有混匀吗?或者电泳时电压不稳定?!还有其他的可能引起这种现象吗?!


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最新回复

  • junhun (2013-12-28 11:08:31)

    QUOTE:

    原帖由 vivian4123 于 2013-12-28 11:07 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')

    这几个条带本来应该是在同一marker水平的,为什么我作出来会是这样有高有低的呢?
    我用5%浓缩胶,12%分离胶,(不好意思之前写反了)分子量55KDa,电压为50v和110v
    蛋白上样量每孔都相同的。
    是因为胶没有混匀吗?或者电泳时电压不 ...
    有以下可能请楼主参考:
    1、上样体的问题,比如说一个是2ul,有的是20ul,这种差距特别大的时候就有可能出现这种情况。楼主说的"蛋白上样量每孔都相同的"不知是不是排除了这种可能。
    2、积层胶的问题,"我用5%分离胶,12%浓缩胶,分子量55KDa,电压为50v和110v"我想楼主应该顺序颠倒了吧。应该是浓缩胶5%,分离胶12%吧。楼主所制胶,积层胶是否一边搞一边低?
    这样也可能出现这种情况。
    3、分离胶的原因,如楼主自己分析可能是没有混匀。
    楼主不会每次都是这样的吧,再做几次看看,如果每次都这样那就是试剂的问题了。、
    good luck
  • gogo (2013-12-28 11:08:54)


    个人认为一般不会因为胶的问题造成这么大的影响(因为条带的变化没有规律性,既不是逐渐加深,也不是逐渐变浅),很有可能是在最开始的蛋白提取和蛋白定量的时候就出了问题。一般蛋白提取液在没有混匀的情况下就拿去定量,很有可能出现上述的结果。所以建议在蛋白提取的过程中找原因。
  • vivian4123 (2013-12-28 11:11:14)

    有以下可能请楼主参考:
    1、上样体的问题,比如说一个是2ul,有的是20ul,这种差距特别大的时候就有可能出现这种情况。楼主说的"蛋白上样量每孔都相同的"不知是不是排除了这种可能。
    2、积层胶的问题,"我用5%分离胶,12%浓缩胶,分子量55KDa,电压为50v和110v"我想楼主应该顺序颠倒了吧。应该是浓缩胶5%,分离胶12%吧。楼主所制胶,积层胶是否一边搞一边低?
    这样也可能出现这种情况。
    3、分离胶的原因,如楼主自己分析可能是没有混匀。
    楼主不会每次都是这样的吧,再做几次看看,如果每次都这样那就是试剂的问题了。、
    good luck
    我上的蛋白量是一样的,比如都上了40ug,但是由于蛋白浓度不一样,所以体积不一样。请问怎么样能保证蛋白量也一样体积也一样呢?!
  • vivian4123 (2013-12-28 11:11:36)

    QUOTE:

    原帖由 junhun 于 2013-12-28 11:08 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')


    有以下可能请楼主参考:
    1、上样体的问题,比如说一个是2ul,有的是20ul,这种差距特别大的时候就有可能出现这种情况。楼主说的"蛋白上样量每孔都相同的"不知是不是排除了这种可能。
    2、积层胶的问题,"我用5%分离胶,12%浓缩 ...
    "蛋白上样量相同”意思是比如都上了40ug蛋白,但是由于蛋白浓度不同,所以体积不同。请问怎样保证每孔蛋白量和体积都相同呢?
  • vivian4123 (2013-12-28 11:11:58)

    QUOTE:

    原帖由 gogo 于 2013-12-28 11:08 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')

    个人认为一般不会因为胶的问题造成这么大的影响(因为条带的变化没有规律性,既不是逐渐加深,也不是逐渐变浅),很有可能是在最开始的蛋白提取和蛋白定量的时候就出了问题。一般蛋白提取液在没有混匀的情况下就拿去定量,很有 ...
    下次我用同一管裂解液来做试试。谢谢!
    排除一切问题,目的是解决问题
  • junhun (2013-12-28 11:20:23)

    QUOTE:

    原帖由 vivian4123 于 2013-12-28 11:11 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')


    "蛋白上样量相同”意思是比如都上了40ug蛋白,但是由于蛋白浓度不同,所以体积不同。请问怎样保证每孔蛋白量和体积都相同呢?
    这个简单,用裂解液调平后再加相应loading buffer,比如一个样是8ul,一个样是2ul,那就把第二个样用裂解液补齐到8ul,然后各加2ulLoading,在上样。
    根据楼主说体积不同,只是上样质量数一致,很可能问题就出在这里了。
    试试吧
    至于楼上所说“很有可能是在最开始的蛋白提取和蛋白定量的时候就出了问题。一般蛋白提取液在没有混匀的情况下就拿去定量,很有可能出现上述的结果。所以建议在蛋白提取的过程中找原因。”
    最终也是导致浓度不准进而体积调不平,可能出现最终的结果。
  • u234 (2013-12-28 11:21:15)


    浓缩胶太短,电压太大,导致没有压直就到分离胶了
  • vivian4123 (2013-12-28 11:21:51)

    QUOTE:

    原帖由 u234 于 2013-12-28 11:21 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')

    浓缩胶太短,电压太大,导致没有压直就到分离胶了
    我是用50v的,电压还大吗?!我是看着压到一条直线才改电压的
  • vivian4123 (2013-12-28 11:22:10)

    QUOTE:

    原帖由 junhun 于 2013-12-28 11:20 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')


    这个简单,用裂解液调平后再加相应loading buffer,比如一个样是8ul,一个样是2ul,那就把第二个样用裂解液补齐到8ul,然后各加2ulLoading,在上样。
    根据楼主说体积不同,只是上样质量数一致,很可能问题就出在这里了。
    试试吧
    ...
    我不是很明白:如果每孔上样蛋白的浓度不同的话,那么虽然我保证了ul数相同的,但是蛋白的ug数不就不同了吗?!上样量不同了结果还有可比性吗?!
  • yonger (2013-12-28 11:22:54)

    QUOTE:

    原帖由 vivian4123 于 2013-12-28 11:22 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')


    我不是很明白:如果每孔上样蛋白的浓度不同的话,那么虽然我保证了ul数相同的,但是蛋白的ug数不就不同了吗?!上样量不同了结果还有可比性吗?! ...
    。。。。。那我试着来回答下,看来上面仁兄的文字表达你没有搞懂
    那直接上数据应该清楚了吧。比如:
    样品a 浓度 10ug/ul
    样品b 浓度 20ug/ul
    上样量为40ug
    那么你需要取
    样品a 4ul
    样品b 2ul
    那么我们可以把体积一起补到8ul(你可以随意取一个大于4的数字,只要跟loading buff的比例好算点),那么我们需要加的裂解液或者NS是:
    样品a中加裂解液4ul
    样品b中加裂解液6ul
    那么样品a离心管中的体积现在是?4+4=8 ,对不?
    同理样品b离心管中的体积也是8
    如果是5x的loading buff那么两个离心管分别加入2ulloading
    总共为4+4+2=10
    2+6+2=10
    一样了吧,而且其中的蛋白质量也是一样了的吧,这样总懂了吧
    如果还是没搞懂。。。。。。。那。。。你数据拿来我们帮你算
  • vivian4123 (2013-12-28 11:23:27)

    QUOTE:

    原帖由 yonger 于 2013-12-28 11:22 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')


    。。。。。那我试着来回答下,看来上面仁兄的文字表达你没有搞懂
    那直接上数据应该清楚了吧。比如:
    样品a 浓度 10ug/ul
    样品b 浓度 20ug/ul
    上样量为40ug
    那么你需要取
    样品a 4ul
    样品b 2ul
    那么我们可以把体积一起补 ...
    明白了,其实就是把蛋白样品稀释到相同的浓度,再加loading!非常感谢这么详细的解答
  • hot_hot_hot (2013-12-28 11:23:49)


    上样体积一定要一样吗?相差个5-10UL不影响吧?
  • 莲花白 (2013-12-28 11:24:12)


    我认为相差越少越好的,毕竟体积还是挺好控制的
  • remonte (2013-12-28 11:24:51)

    QUOTE:

    原帖由 莲花白 于 2013-12-28 11:24 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')

    我认为相差越少越好的,毕竟体积还是挺好控制的
    以前倒是没怎么注意这个问题,下次我也调整一下。
  • bs4665 (2013-12-28 11:25:32)

    QUOTE:

    原帖由 remonte 于 2013-12-28 11:24 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')


    以前倒是没怎么注意这个问题,下次我也调整一下。
    你跟据以上的建议跑胶了吗(我说的是稀释为等体积等浓度的那种)结果怎样?我也面临这样问题,跑出的actin条带量不一致,烦恼啊。期待恢复,谢谢。