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【求助】pubmed上如何确定蛋白质结构中点突变致氨基酸...
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测序后,已知点突变位点,然后确定氨基酸改变,但如何在pubmed上,查找此氨基酸的变化位置是否在蛋白质结构的催化活性中心附近?------------希望高人指点。谢了!
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字体: 小 中 大 | 打印 发表于: 2014-2-03 18:50 作者: fangxiang 来源: 分析测试百科网
最新回复
skytree (2014-2-03 18:50:30)
如果你的蛋白不是一个新蛋白的话,按照下面的办法,可以找出活性位位点
在cuturl('http://www.expasy.org/')网站首页的搜索栏中,搜索你要的蛋白名称或者对应的UniProtKB/Swiss-Prot 的ID号。会给出活性区域以及活性位点的信息。
如果是一个新蛋白的话,通常通过比对找出活性位点。如果你的突变位点在保守位点上,不是一个好消息。反之可以接受。
以上方法供参考!
fangxiang (2014-2-03 18:50:49)
谢谢啊!还有在克隆方面电转化方法是否有哪位高人指点,说实在的现在做试验真是无助,无人可请教。
applebook=213 (2014-2-03 18:51:09)
电击伤
点击这个链接, cuturl('http://www.uniprot.org/uniprot/P82973') 可以知道你的蛋白的活性位点,以及你的蛋白的特性,家族。
还可以在sequence 栏中,点Blast 键,出来许多同源蛋白的比对。可以找到相对保守的区域。
sunshine039 (2014-2-03 18:51:27)
文章在这里:
Journal of Molecular Biology
Volume 327, Issue 4, 4 April 2003, Pages 833-842
NMR Structure of Citrobacter freundii AmpD, Comparison with Bacteriophage T7 Lysozyme and Homology with PGRP Domains
这个文章里已经详细指出了该蛋白质中的重要氨基酸,比如Zn结合氨基酸,催化氨基酸。
fangxiang (2014-2-03 18:52:07)
求助,关于pACYC184的质粒图谱,我想用EcoR1切,那么它的筛选失活标记是什么呢,怎么总搜不到啊。
cwcwcww (2014-2-03 18:52:37)
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