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【求助】western blot条带为什么时有时无
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求助
最近开始做western 发现结果不是很稳定,
我的跑的SDS电泳是6%的分离胶,4%的浓缩胶,样本蛋白总量在50ug,彩色marker标记,目的蛋白130kd
电泳用150v,大概整个跑下来40分钟到1小时的样子,
胶跑好后的转膜过程是:
1..膜剪好后先在甲醇中浸泡10分钟左右,
2.铺“三明治”,转膜液用的是20%甲醛的,湿转
3.电泳和转膜用的都是biorad的机子,
4.铺好后开始转膜,100v 1小时,
然后剪膜封闭,用的是碧云天的试剂,封闭2小时,一抗浓度1:300,SANTA CRUZ的多抗,二抗1:3000,
现在苦恼的是开始做出过两次目的条带,但都比较淡细,参照做得很漂亮,后面一次什么都没有,一次参照actin很好,但是目的条带没有。
考虑是不是转膜时间不够长,还是蛋白抗原量不够,增加蛋白量会不会好点。
还有个问题是,我经常一块板做9个样本,但往往有些道会丢失掉,不知道是什么原因。
小妹刚做不久,各位前辈多多指教
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最新回复
birdfish (2014-2-08 17:25:15)
转移效率怎么样?转膜后可以用丽春红S染液染膜,看看目的蛋白位置有没有条带。
大分子量蛋白的转膜缓冲液可以少加些甲醇甚至不加,加些SDS(0.375-1%),有利于大分子转膜(高含量甲醇利于小分子转膜)。可以试试低电压过夜转(50v或者60v,),转移效率可能好些。
试试加大一抗浓度(可能会导致非特异条带增加)。或者做个斑点印迹(不用电泳和转膜,直接把蛋白样品点在膜上),找出比较合适的一抗和二抗浓度,也能试出比较合适的上样量。
u234 (2014-2-08 17:25:43)
做WB重要的是摸条件 条件摸好了 结果就容易出来了
结果出不来的时候 别着急 一步一步找原因
首先你跑完电泳了 可以用考马染个胶看看 以证明你提的蛋白没有问题
然后转完摸后 用立春红染色 以证明蛋白是否从胶上成功转到摸上了
如果这些没有问题 那以后电泳 转摸的条件就不要变了
摸摸一抗 二抗的浓度 首先还是从抗体的做小稀释比做 即从大浓度开始做
尽管会出现非特异性条带 最起码条带出来了 然后再已不同的抗体稀释比做
背景深了 可以加大封闭液的浓度和时间
总之 试验是慢慢总结出来的 祝楼主试验顺利!!
remonte (2014-2-08 17:26:14)
BOSS2011 (2014-2-08 17:26:50)
谢谢!
remonte (2014-2-08 17:28:13)
有没有人遇到过一次两块板一起做,一块结果还可以,另一块什么都没有呢?我的意思是同样电泳槽,同样的转膜,我常有这样的现象出现
greenbee (2014-2-08 17:28:32)
是的,我的也是,经常同时跑两块胶,一起转膜,完了用丽春红染色,其中一张膜的条带就比较漂亮,一张就较差,应该是溶液在电离过程中浓度不均一的问题吧
seven7 (2014-2-08 17:28:59)
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有可能,因为BIO-RAD的转膜仪,转膜的两个胶的位置是不同的,为了达到相同的效果,我们在转膜中途将两块胶换一次位置。我们转膜一般是200mA*120min,转膜液不加SDS.
redbutterfly (2014-2-08 17:29:53)
seven7 (2014-2-08 17:33:45)
QUOTE:
考马斯亮蓝R250 配方:R250:0.5g;甲醇:250ml;冰乙酸:100ml;定容500mlremonte (2014-2-08 17:34:37)
又摸索了一周
甲醛改为10% 反而只有白片
增加转膜时间分别 为1.5小时和 2小时 actin 效果很好 但是目的条带还是没出来
搞笑的是经常会有很浓的黑点 有时候还在marker附近 背景很干净 不知道出来的什么
用同一张膜做了另一个分子量为150的抗体可以做出来 那说明大分子条带还是能转过去的
考马斯亮蓝染胶也说明转膜没多大问题
问:二抗推荐是驴抗羊 我用的是鼠抗羊 这个有没有问题?
目的蛋白是icam家族的 提取蛋白时是否有什么特别要注意的地方 可以提高提取浓度?
做出过一次 虽然背景比较高 但是条带还是能认清的 能都说明一抗没问题
郁闷了 下一步不知道怎么改进 呜呜
大家有什么好办法 帮忙集思广益下 谢谢
caihong (2014-2-08 17:34:59)
感觉是你sample有问题。怀疑你提取过程中蛋白降解也许比较厉害。
目的蛋白130KD应该算是比较大的蛋白了,电泳和转膜的电压不要太高,你用150v电泳太高了,建议用100v-120v左右,时间长些,1-2h。
你那个150kd能做出来并不能代表这个130也一定可以,两种蛋白的表达量和稳定性你确定一样吗?
taoshengyijiu (2014-2-08 17:35:58)
我想问一下β-actin42KD的转膜条件,不想过夜的那种,我以前用的是100MA,90min,但是DAB显色没有条带显出来,请指导一下
seven7 (2014-2-08 17:36:20)
QUOTE:
我用半干转,按膜的面积算电流,一般一块胶一张膜26ma,1h就可以了vvmmoy (2014-2-08 17:36:37)
做了很多Western的实验,不出条带的原因主要从转膜、二抗和一抗考虑(按照重要性排序)。
对于130kD的蛋白,转膜时间 100v 1小时是不够的,我们一般是110V,90分钟。LZ可以试试。
其二,电泳时150 V ,电压太高。电压越低,蛋白条带分离效果越好。建议采用100V,多跑些时间,这样条带会更清晰。
建议LZ分析下二抗是否坏了。如果是好的,那么就是你 的一抗的问题。分为两个方向:1.浓度不对 2.一抗失效。
而且你竟然把甲醛的浓度改为10%,这不是不能随便改的呀。转膜液20%浓度的甲醛是无数前辈验证过的,是最佳浓度。
wmp1234 (2014-2-08 17:37:05)
我做的目标蛋白是45kd的用100v50分钟就转过去了,条带清晰,可以适当调整上样量,转膜液的配制不变
remonte (2014-2-08 17:37:27)
150的能转过去应该能说明我的转膜时间是充足的,因为sample用sds煮过,是不是说明蛋白的带电量和分子形状都统一化,差异比较小了,当然如果原本丰度不足的话是另讲
改变甲醛浓度主要是考虑分子比较大的缘故,当然这个尝试失败了,没有再试
用的二抗实验室的没人用过
考虑到我的蛋白是跨膜一次的膜蛋白,想是不是蛋白提取时溶解的比较少,重新换强裂解液再提,转膜1.5小时,其余条件不变,结果压片的时候发现整张膜都发亮,以前没出现这样的情况,不知道怎么解释
电泳电压变小条带分的好不好能不能从marker判断啊?如果可以的话,我的marker芬德还是很漂亮的
seven7 (2014-2-08 17:37:46)
hustwb (2014-2-08 17:38:09)
电泳先用60V跑20分钟过积层胶,然后90V跑到底;
对于130kd的条带,100V转一小时肯定不够,可适当在转膜液中加SDS(1g/L),110V转两个半小时,电泳槽周围不加冰块,使转膜液温度在50°C左右最好。
封闭用5%脱脂奶粉1小时就足够了;
biorad的电泳槽靠近负极的那一张膜转的比较好,你可以先把靠近负极的那个三明治拿出来,靠近正极的再转20分钟效果最好。
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