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【求助】双向电泳的分组设计

字体: 小 中 大 | 打印 发表于: 2014-2-13 17:50    作者: 49888    来源: 分析测试百科网

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【求助】双向电泳的分组设计

本人预行双向电泳实验，根据临床要分为a、b、c、d四组，目的在于寻找个组的差异蛋白点。因临床发病率不同，每组样本量分别为7，10，9，2，如何进行双向电泳比较经济而且结果好分析？是标本混合还是每个标本单独进行？几例混合比较好？请高手指点.多谢！！
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  • junjie05 (2014-2-13 17:50:38)


    样品尽量不要混合， 以为不符合统计的基本原理， 只有在样品蛋白少， 不够一次上样才考虑合并。 有些论文将一组混合， 减少个体间差异， 这样不符合道理。reviewer很容易质疑这种做法。技术熟练的人做2D胶也会变异很大， 所以一组3列的最低生物学实验要求不够， 我认为n=5是最基本的， 尤其是对临床病人。 用细胞做2D试验n=3是可以的， 只要你去验证你的结果。 你最后一组例数只有2， 无论如何也要增加到3， 所以你最基本的样本数是5，5，5，3。

  • xue258 (2014-2-13 17:51:03)

    QUOTE:

    原帖由 junjie05 于 2014-2-13 17:50 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')

    样品尽量不要混合， 以为不符合统计的基本原理， 只有在样品蛋白少， 不够一次上样才考虑合并。 有些论文将一组混合， 减少个体间差异， 这样不符合道理。reviewer很容易质疑这种做法。技术熟练的人做2D胶也会变异很大， 所以一 ...
    请教，何为“一组3列”？对细胞，指同一个细胞样品做3次？对临床标本，指一组3个病人还是指1个病人的蛋白做三次2D？

  • pengke1983 (2014-2-13 17:51:26)

    统计里的样本量是样品个数, 不是同一样品重复数次.
    一组3个样品, 不是同一样品重复3次2D. 细胞是指3次试验. 一组3个病人,不是一个病人3次2D.

  • ritou1985 (2014-2-13 17:51:47)

    我也有类似的问题。我的样品是分为a、b、c、d四组，每组有12－16个病人的标本，想做2D-DIGE。如果每组标本不进行适当混合的话工作量会庞大、数据也不好分析。我想每组再分3－4小组，即：每个3－4病人进行混合。你看合理吗？谢谢指教！

  • utt0989 (2014-2-13 17:52:09)


    如果每组有足够的样品, 把其他临床参数优化一下, 年龄,性别,病程, 病理类型, 有无并发症, 合并其他疾病等等, 也可以样品初筛, 做到每个比较样品尽量一致,这样做比你混合样品更有意义, 其他样品可以用于补试验, wertern定量.

  • qhyu (2014-2-13 17:52:29)


    我也对分组这个问题，烦恼，临床上的实验就是对样本量要求很大，但是如果每人跑一张胶，这个费用肯定拿不出来啊，一张胶就是一百多块，还不加其他试剂

  • cwcwcww (2014-2-13 17:52:46)


    有个问题 不同病人的样品结构蛋白差异很大 分析时如何处理?
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