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【求助】目的蛋白表达不出来
最近跑了很多次小肽电泳,可是目的蛋白还是没有表达出来。【求助】目的蛋白表达不出来
我跑的是4%的浓缩胶,10%的分离胶。30V恒压25min跑完浓缩胶,150v恒压2h跑完分离胶。条带清晰也很直。
我做了不同终浓度的IPTG诱导表达,0.2mmol、0.3mmol、0.4mmol、0.5mmol、0.8mmol、1mmol的,37度,200转|分,诱导三小时后收集菌液。加入IPTG之前测菌液的OD值都是介于0.5-0.7 之间。
高手们帮忙分析下啊,是不是我的分离胶浓度太小了啊?
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最新回复
pengke1983 (2014-2-21 15:40:18)
才诱导三小时!
把诱导时间延长点试试!
pengke1983 (2014-2-21 15:46:06)
10KD以下的话,最好跑tricine-sds-page电泳!
hold住 (2014-2-21 15:46:25)
tricine-sds-page电泳,不是很好跑啊.
tuuu2 (2014-2-21 15:48:40)
我的目的蛋白是4.2KD的
我跑的就是Tricine电泳
gogo (2014-2-21 15:53:22)
10%浓度太低了吧,建议增加胶浓度,同时那么小的蛋白没有必要跑到胶低,即使溴芬兰没有跑出,蛋白也很容易跑出去,跑到中下部就可以了,可以确保你的蛋白没有跑出去
mimili_901 (2014-2-21 15:53:42)
10%浓度太低了吧,建议增加胶浓度,同时那么小的蛋白没有必要跑到胶低,即使溴芬兰没有跑出,蛋白也很容易跑出去,跑到中下部就可以了,可以确保你的蛋白没有跑出去
gogo (2014-2-21 15:54:09)
tuuu2 (2014-2-21 15:58:11)
请问,把表达的量放大是什么意思啊?我在分离胶中加了甘油,这几天跑了几次16.5%的胶,但是还是没有看出差异,在跑胶的过程中,指示剂在分离胶中跑的很快,我用的是80v跑的分离胶,指示剂跑出去时,蛋白只跑了分离胶的一半,是不是胶浓度越大,用的电压要减小?
tuuu2 (2014-2-21 15:59:47)
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我跑的是梯度较,浓缩胶是4%的
xue258 (2014-2-21 16:03:01)
我没听说过胶浓度提高就改变电压的说法。Tricine电泳的正负极缓冲液很重要,检查一下配错了没有,一开始尽量不要回收利用,当你把体系建起来后可以回收用,毕竟科研经费有限。
我加甘油跑过,还是可以的,但没有尿素效果好。还可以尝试加上夹层胶跑跑看。电压不要太高,第一次跑时我120V跑到底,结果2h跑完了,就一条带,但明显是没有分开。
如果做不出来不要盲目再去试,好好检查一下配的试剂有没有问题。
xiaoxiaoniao (2014-2-21 16:04:27)
我最近也在做小分子蛋白的串联表达,表达的蛋白大概6K多,但通过Tricne小分子蛋白电泳未见目的蛋白条带。37℃,诱导了5个小时。不知道是什么原因,急呀!
one (2014-2-21 16:04:47)
喵咪 (2014-2-21 16:05:36)
同意前几位的说法,你用的SDS胶浓度太低了
建议用20%以上的,可参见 蛋白质技术手册
最好改用tricine胶
另外,小蛋白易受蛋白酶降低,可尝试加一点蛋白酶抑制剂
如果表达量低的话也会使PAGE不可见,细菌裂解液可以用饱合硫酸铵之类的浓缩一下上样,上样可用5倍的buffer,配制方法参见蛋白质技术手册,目的是使目的蛋白的上样量尽量的多。
还是不可见就做一两个western,灵敏度更高些。
再不行就换载体,换宿主菌重新来。
还有个建议,这个小蛋白内果有很多大肠稀有密码子话就很难表达了,不妨到cuturl('http://www.evolvingcode.net/codon/cai/cais.php') cuturl('http://gcua.schoedl.de/') 这两个地方分析一下,实在不行就重新合成基因,反正也不长。
H2O (2014-2-21 16:06:02)
可能原因:
1. 楼上几位已经探讨过的跑胶问题,不再累述!
2. 表达体系:
也许你没有做过密码子优化,你的基因涉及多量稀有密码子,而表达菌又不提供稀有密码子翻译是所需的tRNA,导致翻译终止。建议更换宿主菌。
个人认为表达的问题可能性大,关于表达,园子里很多主任给出过解释。
后续可以再讨论,祝试验成功!
66小飞侠 (2014-2-21 16:06:22)
不知道你用的是什么表达系统,原核系统对一些蛋白质是有限制的,如跨膜蛋白在原核系统中就无法表达,因此,建议你查清楚目标蛋白质的特性,选择合适的表达系统,再加上楼上的所有建议,OK,祝你好运!
49888 (2014-2-21 16:08:24)
xyw5 (2014-2-21 16:08:46)
fsdd817 (2014-2-21 16:09:22)
那小蛋白诱导表达的成功机会很低,是吗?
【求助】目的蛋白表达不出来