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【求助】IEF时电压上不去
【求助】IEF时电压上不去
仪器:GE的IPGphor
样品:原始蛋白样品和沉淀除盐样品
现象:
最初用原始样品跑了7cm胶条,设置电压4000V,可实际只能达到1500左右,跑了24个小时以上,总的VHrs也不够,后又多跑了一会;最终SDSPAGE染色,还能分辨点的分布。
分析及咨询技术支持后经除盐处理样品,同样条件,仍然出现同样问题,没有多跑,机子按设置停止(总的VHrs仍不够,为什么会停?)最终SDSPAGE染色,基本上看不到明确的点(都是横纹)。
再次咨询技术支持,经他们建议测试机子无明显故障,说7cm胶条电压不容易上去,改用18cm胶条,同时两个样品电泳,仍然出现上述问题:设置电压8000V,只能到4000左右。
问题
1。此种问题是何原因?如何解决?
2。IEF时未达到设置的VHrs,机器为何会走向下一步和停止?
Tips:
1。同样地原始样品(未除盐的)在1个月前曾经试过,一切正常。
2。所用溶液没有变化,遵循一个protocol。
3。今日偶然发现,运行中(当然要暂停)取下一个胶,电压立即到8000V(此时机器protocol仍是strip为2)。当更改protocol的strip为1(只有1个胶槽),电压就降下来了;或者不更改protocol,放回另一个胶槽(同时运行1个2胶槽)电压也降下来了。
4,电流每次都可达较高水平(50uA)
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最新回复
feima+ (2014-3-23 23:48:04)
推荐两个方法:
1、延长低压时间除盐
2、中间换滤纸
具体原因看这个帖子
cuturl('http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=65&id=10443526&sty=1&tpg=1&age=0')
koook5695 (2014-3-23 23:48:23)
谢谢
好像那个帖子也没有说明原因和解决办法啊!
样品我们已经除盐处理过了(1个月前曾经试过除盐的样品,一切还正常)。现在我们除盐时间2个小时以上,最长一次5个小时呢
sunnyB (2014-3-23 23:48:42)
我用的17cm胶条,遇到同样的问题。低压长时除盐效果也不好,经丙酮沉淀后,刚才观察,电压仍不能达到良好效果,我想也许是不是核酸在作怪,你有没有用核酸酶处理?在者,你上样量是多少,是不是加大上样量可以增加蛋白点数,我曾加倍上样量,点会比原来多很多。
koook5695 (2014-3-23 23:49:03)
ending (2014-3-23 23:49:20)
提几点建议供参考:
1。彻底清洁IEF的电极板
2。检查你的每一个胶条槽
3。重配水化液,特别注意一下IPG buffer的质量,有没有过期。
rxcc33 (2014-3-23 23:49:36)
IPG buffer过期不久的话基本上没有关系的,我们用的胶条,buffer还有一些其他的东西基本上都过期了,跑起来还可以。
bluelake (2014-3-23 23:50:07)
电压上不去一般是盐离子浓度过高,因为跑第一向时为防止烧坏胶条等一般会限制电流,当你离子浓度过高,电压就会上不去。你试试降低ipg buffer浓度,0.5%其实已经足够。要不就是你样品提取的问题了
至于你的第三点疑问,答案很简单:因为每根胶条限流50uA,两个加起来就是100uA,拿掉一根当然电压能够加倍
koook5695 (2014-3-23 23:51:30)
试剂应该没有问题,因为使用别人剩下的(最近还在做)
胶条槽已经彻底清洗
换过两次水化液了
IPGbuffer目前浓度为0.2%
---现在刚重新配完水化液,明天重新提取蛋白---
看看吧,不行就搭盐桥,有点怕地说~~~
koook5695 (2014-3-23 23:53:06)
1。更改样品制备方法--减少能舍弃的操作步骤,来尽可能减少引入增加干扰的因素
2。重新配置液体,校正溶液的pH
3。沉淀除盐
4。盐桥
5。延长除盐时间
6。更换胶条
~~~
大家帮我想想还有什么可以改进的?
难道真的要买一个cleanup,不是心疼money主要是担心用了还是一样
2541 (2014-3-23 23:53:24)
上样量多大?可能上样量太大了,前一阵和你出现同样的问题,11cm的胶条电压只能到4000v,上样量240ug(银染显色,GE公司),后来调整了上样量,改为100-120ug左右,现在一切正常了。clean up kit 可以适当的去除一些条纹,但是蛋白点也明显减少。
jingling845 (2014-3-23 23:53:40)
检查一下你配重涨液所用的水吧, 我前几天刚刚出现这种情况,查了半天,连空胶槽都试了。最后发现是水的问题。
tuuu2 (2014-3-23 23:53:58)
推荐建议你对方法的改进如下:
1. 对你的样品进行TCA- 丙酮沉定(但是有可造成某一些蛋白不容解).
2. 水化上样液的DDT量减少.两性电解质量调小.
3、适当延长低压时间除盐
4.必要时聚焦前更换盐桥.
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