【求助】如何获得基因序列

最新回复

• jrwyyplt (2014-5-10 17:48:35)

  
  进入www.ncbi.nlm.nih.gov
  然后再下拉框选gene,填入基因名即可。
  我一般都是选择Nucleotide进行序列的查找。

• 小鱼鱼 (2014-5-10 17:49:06)

  以下mRNA序列的相应DNA是不是GeneID:418545?我还是没有找到.请帮帮忙.
  LOCUS XM_416752 1791 bp mRNA linear VRT 16-NOV-2006
  DEFINITION PREDICTED: Gallus gallus similar to cystathionine beta-synthase
  (LOC418545), mRNA.
  ........
  gene 1..1791
  /gene="LOC418545"
  /note="Derived by automated computational analysis using
  gene prediction method: GNOMON. Supporting evidence
  includes similarity to: 1 mRNA, 2 ESTs, 4 Proteins"
  /db_xref="GeneID:418545"

• jrwyyplt (2014-5-10 17:49:29)

  应该就是这个啦！！！

• bamboo16 (2014-5-10 17:49:50)

  QUOTE:

  原帖由 小鱼鱼 于 2014-5-10 17:49 发表
  以下mRNA序列的相应DNA是不是GeneID:418545?我还是没有找到.请帮帮忙.
  LOCUS XM_416752 1791 bp mRNA linear VRT 16-NOV-2006
  DEFINITION PREDICTED: Gallus gallus similar to cystathionine beta-synthase
  (LOC418 ...

  相关疾病：
  电击伤
  我在PUBMED中选择gene输入418545 就得到了。
  1: LOC418545 Links
  similar to cystathionine beta-synthase [Gallus gallus]
  Chromosome: 1
  GeneID: 418545
  然后你直接点击 LOC418545 就可以得到该基因的详细信息了。
  应该就是你所写的那些。

• 小鱼鱼 (2014-5-10 17:50:10)

  我进去了,得到的是:
  LOCUS NW_001471534 23138 bp DNA linear CON 16-NOV-2006
  DEFINITION Gallus gallus chromosome 1 genomic contig, reference assembly
  (based on Gallus_gallus-2.1).
  好象不是cystathionine beta-synthase [Gallus gallus] 基因?

• biabiade (2014-5-10 17:50:30)

  
  应该就是你要的！！！

• biabiade (2014-5-10 17:50:47)

  
  这是第一条染色体的全部序列信息！！！

• hold住 (2014-5-10 17:51:04)

  我急需构建质粒，需要mus NPC1mu序列设计引物进行RT-PCR,请各位高手帮忙！

• lixi559 (2014-5-10 17:51:33)

  我进去了,得到的是:
  LOCUS NW_001471534 23138 bp DNA linear CON 16-NOV-2006
  DEFINITION Gallus gallus chromosome 1 genomic contig, reference assembly
  (based on Gallus_gallus-2.1).
  好象不是cystathionine beta-synthase [Gallus gallus] 基因?
  ......
  
  ==================================
  
  这应该是GENOMIC DNA。不是你要的基因。

• 小鱼鱼 (2014-5-10 17:52:14)

  
  我也认为是GENOMIC DNA的部分,通过比对应该的到我要的基因,可是我在NCBI
  上进行BLAST,得到的信息比较零乱,谁知道更好的办法?用什么软件?如何操作?