【求助】有几个蛋白名称但是不知道其功能及属于...

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• mimili_901 (2014-5-15 15:01:45)

  
  去NCBI主页查，数据库选protein，输入蛋白名称即可。
  比如Peptidylarginine deiminase precursor的查询结果如下：
  cuturl('http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?db=protein&val=73621345')
  SOURCE Porphyromonas gingivalis
  [FUNCTION] Deiminates the guanidino group of C-terminal arginine
  residues on a variety of peptides, including the vasoregulatory
  peptide-hormone bradykinin, to yield ammonia and a citrulline
  residue. May promote the growth of the pathogen in the periodontal
  pocket by producing ammonia, ammonia having a protective effect
  during acidic cleaning cycles in the mouth.

• yes4 (2014-5-15 15:02:08)

  
  我查过，但是有的蛋白上没有解释得这样详细，并且我主要想知道它主要位于细胞的什么部位

• yes4 (2014-5-15 15:03:47)

  
  我通常用cuturl('http://www.genecards.org/')去查蛋白质信息，包括细胞定位信息。
  如果是没人研究或研究的较少的蛋白可以用蛋白定位预测工具去预测， 这类网站很多，GOOGLE以下就有很多，比较常用的：
  PSORT：cuturl('http://psort.nibb.ac.jp')
  By amino acid composition information and sorting signal knowledge
  TargetP：cuturl('http://www.cbs.dtu.dk/services/TargetP/')
  By discriminating the individual targeting signal peptide
  MitoProt：cuturl('http://ihg.gsf.de/ihg/mitoprot.html')
  By discriminating mitochondrial and chloroplast signal peptide
  Predotar：cuturl('http://www.inra.fr/Internet/Produits/Predotar/')
  By discriminating mitochondrial, chloroplast signal peptide
  NNPSL：cuturl('http://predict.sanger.ac.uk/nnpsl')
  By amino acid composition
  SobLoc：cuturl('http://www.bioinfo.tsinghua.edu.cn/SubLoc/')
  By amino acid composition
  MultiLoc
  cuturl('http://www-bs.informatik.uni-tuebingen.de/Services/MultiLoc')
  我用TargetP， SobLoc，MultiLoc 作大批量蛋白预测。
  如果就几个蛋白PSORT很好。

• 831226 (2014-5-15 15:06:38)

  
  查ＧＯ去．

• yes4 (2014-5-15 15:07:52)

  
  就是通过质谱分析出的，但是你说的数据库连接我不是很明白

• tuuu2 (2014-5-15 15:09:00)

  
  相关疾病：
  类风湿关节炎
  肽酰基精氨酸脱亚氨酶(PADI)是一种能够催化蛋白质肤链中精氨酸残基脱亚氨基产生瓜氨酸残基的酶。PADI在多种组织中表达，具有底物特异性和组织表达特异性。PADI在类风湿关节炎(RA)发病和诊断方面的作用日益受到临床的重视。
  Peptidylarginine deiminase precursor 肽酰基精氨酸脱亚氨酶前体---------
  －－－－国际检验医学杂志2006年1月第27卷第1期Int J Lab Med,January 2006,Vol.27,No.
  Glyceraldehydes 3-phosphate dehydrogenase 3-磷酸甘油醛脱氢酶
  thioredoxin 硫氧还蛋白
  zinc carboxypeptidase 锌羧肽酶