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【求助】等电聚焦中两性电介质的最佳浓度,其对聚焦...
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请问各位做双向电泳的同门专家:两性电介质在等电聚焦中最佳浓度怎么定量,其浓度差异对聚焦过程有何影响?
我使用过的浓度是PH3-10:0.4%,100ul;PH4-6:0.8%,200ul;PH6-8:0.8%,200ul。
其效果都不太好。
我做的是植物的种子蛋白质。
请赐教!!
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66+77 (2014-5-22 10:40:49)
做双向电泳的两性电介质在等电聚焦中最佳浓度怎么定量,其浓度差异对聚焦过程有何影响?
这个问题其实是早就有人做过相关研究拉,一般来说,加的两性电解质并不是越多越好,加的越多,聚焦中的除盐都非常花时间,升压比较慢,造成样品损失较大(主要是降解和蛋白修饰)。根据我做的经验嘛,一般是加0.2%(W/V)的BIo-lyte电解质(不考虑PH范围影响)。
从理论上说就是你的两性电解质不能过多,多了反而不利于你聚焦充分,小分子电荷离子多了,在你的IPG条里面乱串。
分析你的原因应该是你的样品处理需要进一步的优化,至于你怎么来优化,我就不知道你的样品是什么?怎么处理而来的拉?
junhun (2014-5-22 10:43:02)
谢谢指教!!
就是说我加的电介质太多?
我做的IEF胶条和样品裂解液都是按照10ml体积来配制的。按照0.2%(W/V)浓度的电介质来算就是加50ul左右啦!!这样的话是不是起始电流就非常的低啊?
而按照我做的浓度:PH3-10:0.4%,100ul;PH4-6:0.8%,200ul;PH6-8:0.8%,200ul,起始电流会达到2mA。我聚焦结束时也只能降到0.3-0.4mA。
我用的电泳装置是BIO-RAD的Mini-PROTEIN 3Cell。跑的样品是油料作物种子全蛋白。
junhun (2014-5-22 10:43:48)
这是我的电泳结果图,请各位专家多多指点赐教!!
46887098.jpg
bring (2014-5-22 10:47:09)
junhun (2014-5-22 10:47:40)
我用10%三氯乙酸(丙酮配制,含0.07%2-巯基乙醇)沉淀蛋白质,再分别用冷丙酮和80%的冷丙酮洗涤沉淀各两次。最后用真空抽干机风干,常温。-20度保存。
junhun (2014-5-22 10:48:10)
66736986.jpg
ero11 (2014-5-22 10:48:41)
你的上样量是多少啊?为什么不用银染啊?你的考染胶看样子很多小点都没看到,在分析的时候还是用银染吧。
junhun (2014-5-22 10:50:03)
请问蛋白质的银染色步骤是怎样的啊?麻烦推荐一下吧。
谢谢啦!!
131415 (2014-5-22 10:50:26)
1、固定 无水乙醇 100ml
冰醋酸 25ml
加去离子水至 250ml 30min
2、敏化 无水乙醇 75ml
戊二醛(50%w/v)* 0.625ml
硫代硫酸钠 0.5g
醋酸钠 17g
加去离子水至 250ml 30min
3、冲洗 去离子水 250ml 3Ⅹ10min
4、银反应 硝酸银 0.625g
甲醛(37%w/v)* 0.1ml
加去离子水至 250ml 20min
5、冲洗 去离子水 250ml 2Ⅹ1min
6、显色 碳酸钠 6.25g
甲醛(37%w/v)* 0.05ml
加去离子水至 250ml 2-5min
7、终止 EDTA-Na22H2O 3.65g
加去离子水至 250ml 10min
junhun (2014-5-22 10:50:45)
谢谢,楼上的朋友!!!
请问一下,我上面的电泳图前沿有一水平条带,好像有些蛋白质在条带中没有分开。怎么才能除去前沿条带,把蛋白分开。
是不是平衡液中2-巯基乙醇用量太多,我是用5%的2-巯基乙醇进行平衡的,在蛋白质裂解液中2-巯基乙醇也是5%。
请各位大侠指教!!
junhun (2014-5-22 10:51:51)
谢谢啦!
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