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【求助】有防止蛋白吸附到EP管壁上的试剂么?
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发表于: 2014-5-31 09:06 作者: 水母 来源: 分析测试百科网
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【求助】有防止蛋白吸附到EP管壁上的试剂么?
大家好,有什么试剂可以防止蛋白在ep管壁上吸附呢?听说做蛋白测序的时候有防止蛋白在玻璃上吸附的试剂,是哪种试剂呢??前辈们多多赐教啊!!
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【求助】有防止蛋白吸附到EP管壁上的试剂么?
我也来说两句
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zsxan1990
(2014-5-31 09:06:30)
一般用硅化的进口ep管,稍微好点
xyw5
(2014-5-31 09:10:54)
买进口的低吸附的管子吧
水母
(2014-5-31 09:11:19)
我本来就不在国内做啊,在香港,管子是进口的,就是不知道是不是硅化低吸附的!谢谢各位,又什么意见再提醒提醒小弟!
mimili_901
(2014-5-31 09:14:29)
香港。。。如果你们是专门做蛋白质组的应该用的就是低吸附的了
kuaizige
(2014-5-31 09:14:53)
可以在保存剂中加入适量的BSA
水母
(2014-5-31 09:15:16)
我做的是Kinase assay,substrate是用beads连着的,是研究细胞lysate里面的kinase活性,反应完后wash三次,背景相当的浓,而且不加beads,只有lysate的管的背景信号丝毫不弱,怀疑lysate里的蛋白自身磷酸化,而且洗不掉,粘在管壁,加loading dye后加热后就掉下来,电泳,干胶,自显影后背景很浓,郁闷中! 请大家帮我想想办法!
xue258
(2014-5-31 09:15:32)
吸附是因为疏水相互作用吧,加点吐温或者triton试试,硅烷化只适合玻璃,没听说塑料可以.
水母
(2014-5-31 09:15:51)
0.1%的triton,or sds,甚至1%sds都试过了,背景都很浓,现上传一张图片!这个gama-p32-ATP很贵,哎,用起来压力大啊!大家帮帮忙!万分感激!
99159397.jpg
水母
(2014-5-31 09:16:39)
我要的目的条带很短,箭头所示! 但是这个background is so heavy.这个蛋白是GST融合蛋白,其实是个短肽,我们研究磷酸化位点的!
zhenxin
(2014-5-31 09:17:01)
非特异蛋白在Beads上,不再管子上。
beads 封闭了吗?
即使封闭,也会有很多非特异结合的, 细胞内的激酶活性使许多蛋白标记上了p32ATP ,实验设计有点问题。
降低背景的方法:
1. 优化beads的封闭条件
2.将最后的洗脱液用离心超滤(1.5 ml 或0.5ml ,有售), 初步分离一下,在检测。
3. 优化激酶的反应条件,可以减少一些p32ATP的用量,调整一下ATP与 p32ATP 比例;其他的升华条件等等
水母
(2014-5-31 09:17:20)
1,奇怪的是没有加beads,只加lysate和其他反应成份的管里也出现了很强的背景,而且这个对照也是同样wash三次的。
2,我没有洗脱啊,利用beads连着我的substrate,通过离心,洗这个beads,及洗掉反应体系里面剩余的hotATP.
3, ATP和hotATP的比率不知道怎么调节,有没有经验值?我这里的hot ATP所剩很少了。我看paper及protocol上讲ATP终浓度100umol,我用的不到这个浓度,HOT ATP加得比较少。谢谢你们!
还有建议么,我很急啊!谢谢!!!!
sunnyB
(2014-5-31 09:17:38)
1. 电泳前,要把substrate和beads 分开吗? 如何分开呢?你说:“加loading dye后加热后就掉下来” 正式洗脱啊 。这样地洗脱,能保证只有substrate,没有beads上其他的被磷酸化的protein 掉下来吗?一般这种洗脱方式,所用在Beads上的分子全都会下来。
2 即使管子吸附蛋白也不妨, 移到新管再煮beads,保证蛋白100%来自beads.
3. cell lycyte 成分复杂,细胞内的激酶活性使许多蛋白标记上了p32ATP ,而不只是你的底物。即使封闭beads, 这些带有p32ATP的产物蛋白,还是会少量的非特异的结合到beads上,而放射自显影非常灵敏,这就是胶上看到的大分子量的信号。
3 我又仔细看了一下帖子,你封闭beads了吗? triton,sds,要在封闭Beads的前提下才有用。用高浓度BSA封闭(5%)(如果BSA不被磷酸化,在你的实验中),会相对降低你的背景。
4 有其他方法切下你的底物吗(如酶法,竞争洗脱,或条件洗脱)?那将是最好的办法:如果只能煮,BSA封闭后效果也不好,那就只能想办法把你的
substrate 同其他蛋白分开,再作自显影。
5 hotATP比率倒不是最重要。可以参照文献。
水母
(2014-5-31 09:18:14)
谢谢楼上中肯的意见!
我之所以没有事先洗脱beads上的substrate是想借助beads wash我的反应产物,将lysate里的其他成份,以及多余的hotATP都洗掉,然后loading dye洗脱电泳,可是感觉很多自身磷酸化的蛋白黏在管壁和beads上,现在正考虑将beads换管的做法。
实验中我没有封闭beads,如何封闭呢?BSA我这里有。
谢谢!
sunnyB
(2014-5-31 09:18:35)
你的实验中应设一对照:只用beads+ cell lysate,。
我做过同样的实验,请一定封闭beads, 否则还有许多杂蛋白。
在连上substrate后, 加3%-5% BSA ,孵育30 分。(选合适的buffer和温度)
洗3次,再作反应。
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zsxan1990 (2014-5-31 09:06:30)
xyw5 (2014-5-31 09:10:54)
买进口的低吸附的管子吧
水母 (2014-5-31 09:11:19)
我本来就不在国内做啊,在香港,管子是进口的,就是不知道是不是硅化低吸附的!谢谢各位,又什么意见再提醒提醒小弟!
mimili_901 (2014-5-31 09:14:29)
香港。。。如果你们是专门做蛋白质组的应该用的就是低吸附的了
kuaizige (2014-5-31 09:14:53)
水母 (2014-5-31 09:15:16)
xue258 (2014-5-31 09:15:32)
水母 (2014-5-31 09:15:51)
99159397.jpg
水母 (2014-5-31 09:16:39)
我要的目的条带很短,箭头所示! 但是这个background is so heavy.这个蛋白是GST融合蛋白,其实是个短肽,我们研究磷酸化位点的!
zhenxin (2014-5-31 09:17:01)
非特异蛋白在Beads上,不再管子上。
beads 封闭了吗?
即使封闭,也会有很多非特异结合的, 细胞内的激酶活性使许多蛋白标记上了p32ATP ,实验设计有点问题。
降低背景的方法:
1. 优化beads的封闭条件
2.将最后的洗脱液用离心超滤(1.5 ml 或0.5ml ,有售), 初步分离一下,在检测。
3. 优化激酶的反应条件,可以减少一些p32ATP的用量,调整一下ATP与 p32ATP 比例;其他的升华条件等等
水母 (2014-5-31 09:17:20)
1,奇怪的是没有加beads,只加lysate和其他反应成份的管里也出现了很强的背景,而且这个对照也是同样wash三次的。
2,我没有洗脱啊,利用beads连着我的substrate,通过离心,洗这个beads,及洗掉反应体系里面剩余的hotATP.
3, ATP和hotATP的比率不知道怎么调节,有没有经验值?我这里的hot ATP所剩很少了。我看paper及protocol上讲ATP终浓度100umol,我用的不到这个浓度,HOT ATP加得比较少。谢谢你们!
还有建议么,我很急啊!谢谢!!!!
sunnyB (2014-5-31 09:17:38)
1. 电泳前,要把substrate和beads 分开吗? 如何分开呢?你说:“加loading dye后加热后就掉下来” 正式洗脱啊 。这样地洗脱,能保证只有substrate,没有beads上其他的被磷酸化的protein 掉下来吗?一般这种洗脱方式,所用在Beads上的分子全都会下来。
2 即使管子吸附蛋白也不妨, 移到新管再煮beads,保证蛋白100%来自beads.
3. cell lycyte 成分复杂,细胞内的激酶活性使许多蛋白标记上了p32ATP ,而不只是你的底物。即使封闭beads, 这些带有p32ATP的产物蛋白,还是会少量的非特异的结合到beads上,而放射自显影非常灵敏,这就是胶上看到的大分子量的信号。
3 我又仔细看了一下帖子,你封闭beads了吗? triton,sds,要在封闭Beads的前提下才有用。用高浓度BSA封闭(5%)(如果BSA不被磷酸化,在你的实验中),会相对降低你的背景。
4 有其他方法切下你的底物吗(如酶法,竞争洗脱,或条件洗脱)?那将是最好的办法:如果只能煮,BSA封闭后效果也不好,那就只能想办法把你的
substrate 同其他蛋白分开,再作自显影。
5 hotATP比率倒不是最重要。可以参照文献。
水母 (2014-5-31 09:18:14)
我之所以没有事先洗脱beads上的substrate是想借助beads wash我的反应产物,将lysate里的其他成份,以及多余的hotATP都洗掉,然后loading dye洗脱电泳,可是感觉很多自身磷酸化的蛋白黏在管壁和beads上,现在正考虑将beads换管的做法。
实验中我没有封闭beads,如何封闭呢?BSA我这里有。
谢谢!
sunnyB (2014-5-31 09:18:35)
你的实验中应设一对照:只用beads+ cell lysate,。
我做过同样的实验,请一定封闭beads, 否则还有许多杂蛋白。
在连上substrate后, 加3%-5% BSA ,孵育30 分。(选合适的buffer和温度)
洗3次,再作反应。
【求助】有防止蛋白吸附到EP管壁上的试剂么?