【求助】如何寻找保守序列？

最新回复

• 7437654 (2014-10-26 20:07:56)

  QUOTE:

  原帖由 年轮 于 2014-10-26 20:07 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')
  本人菜鸟一个，最近刚接触基因重组这块，课题是连接两个基因片段。第一段的序列已经找到，为乙肝病毒的一段，前s1，s2段，共522bP。需要设计引物扩增出来，但是老师说先找保守序列，这个怎么找难为我了，请高手指教下，非常感激！ ...

  去NCBI，BLAST，找保守区域

• 年轮 (2014-10-26 20:08:42)

  blast了，可是还是不懂。问了n个人，没人用过。

• gogo (2014-10-26 20:09:05)

  
  你先把你已有的一段序列在NCBI上BLAST一下，找到一些源性较高的序列（也是该基因，只不过是不同的物种的，在NCBI上能找到一些），然后复制下来，通过DNAman比对一下，会自动生成，保守序列就是不同基因在某一段上完全一样的区域，或是绝大多数碱基在某一块相同，用那个区域的序列在primer中设计引物即可！
  

• newway (2014-10-26 20:09:25)

  
  
  找同源基因，在DNAMAN上多序列比对，几条序列相同的地方就是保守序列，然后根据保守区域的序列设计引物。
  

• flower@@ (2014-10-26 20:10:01)

  
  请问楼主现在是不是已经知道怎么找保守序列了？？求帮助！
  

• one (2014-10-26 20:10:28)

  求具体步骤~本人太笨，看到NCBI那些英文就什么也不知道了