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【求助】Realtime PCR 扩增曲线峰值和斜率对于相对...
用Bio-Rad iQ5做的 Realtime pcr 扩增曲线如下图【求助】Realtime PCR 扩增曲线峰值和斜率对于相对...
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2013-7-24 21:52 上传
左边的6条是内参GAPDH,片段比较长500+bp;右侧6条是目的基因,片段210bp
疑问:
1、为什么各条曲线的峰值差异这么大,同样是内参,有的峰值不到1500,有的超过2000?
2、内参的峰值都比目的基因高,是不是因为内参片段比目的基因片段长很多的原因?
3、峰值高低、扩增曲线斜率对分析结果(相对定量)有什么意义?
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最新回复
nn255 (2014-10-27 17:55:22)
你用taqman 还是sybr ,如果是taqman,应该是样本中内参多。如果是用taqman,做fam荧光会比其他荧光强很多,尤其是做双重。
水母 (2014-10-27 17:55:41)
QUOTE:
内参和目的基因都是用的SYBR,为什么内参峰值高低差别也很大?zhy平平 (2014-10-27 17:56:01)
wu11998866 (2014-10-27 17:56:17)
水母 (2014-10-27 17:56:42)
QUOTE:
内参模板都是1uL/管,但是不同样本的RNA浓度差异,有的3000+ng/uL,有的1000+ng/uL,逆转录的时候也都是按照1uL取的RNA,会不会造成了不同样本间cDNA浓度差异也大?不过操作过程也是容易导致误差的重要环节,哎。。。
水母 (2014-10-27 17:57:04)
QUOTE:
内参是一个(左边6条,峰值高的),目的基因是一个(右边6条,峰值低的)你指的不像一个基因是什么意思呢?bgf5 (2014-10-27 17:57:23)
定量关键看阈值以下那段,具体最后峰高多少没有太大的意义,图中内参峰低的CT值和峰高的CT值有明显差别吗?还有与之相对应的目的片段的CT值如何?是不是有相同的变化趋势?
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