如何判断Q-PCR内参基因是多拷贝还是双拷贝?

我正在做Q-PCR检测人类基因敲除是否成功,原理如下:以双拷贝基因为内参,经2CT法计算后为1;若成功敲除一个等位基因,则Q-PCR结果为0.5;若没有敲除则结果仍为1。

但现在有一个问题是要找到合适的内参基因。而一般用的rRNA等都是多拷贝的,所以想请教大家如何判断一个基因是多拷贝还是双拷贝?我在NCBI等数据库中没有找到相关信息。难道只有查相关文献才能找到吗?
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  • notrjhn (2009-2-04 22:51:40)

    基因组dna里pbgd基因是的,常用的beta actin是多拷贝,有很多假基因。

    但是楼主的试验一定需要单拷贝么?只要内参基因的拷贝数不发生变化就可以了嘛?当然最终比值可能不是1,是某一个确定的值就是了,成功敲出后比值变为原来的一半。

    这种试验还是有点意思的,ms有点难度。