Western实验步骤【转自 丁香园论坛】

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Western实验步骤


Western,也称Western blot、Western blotting、Western印迹,是用抗体检测蛋白的重要方法之一。Western可以参
考如下步骤进行操作。

1.
收集蛋白样品(Protein sample preparation)

Ø 可以使用适当的裂解液,例如碧云天生产的Western及IP细胞裂解液,裂解贴壁细胞、悬浮细胞或组织样品。对于某些特定的亚
细胞组份蛋白,例如细胞核蛋白、细胞浆蛋白、线粒体蛋白等,可以参考相关文献提取这些亚细胞组份蛋白,也可以使用试剂盒
进行抽提,例如碧云天生产的细胞核蛋白与细胞浆蛋白抽提试剂盒。

Ø 收集完蛋白样品后,为确保每个蛋白样品的上样量一致,需要测定每个蛋白样品的蛋白浓度。根据所使用的裂解液的不同,需要
采用适当的蛋白浓度测定方法。因为不同的蛋白浓度测定方法对于一些去垢剂和还原剂等的兼容性差别很大。如果使用碧云天生
产的Western及IP细胞裂解液,可以使用BCA蛋白浓度测定试剂盒。

2. 电泳(Electrophoresis)

(1) SDS-PAGE凝胶配制

Ø SDS-PAGE凝胶可以参考一些文献资料进行配制,也可以使用碧云天生产的SDS-PAGE凝胶配制试剂盒。该试剂盒提供了除水和配
胶器具外的所有试剂以及配制各种浓度SDS-PAGE的配方。

(2) 样品处理

Ø 在收集的蛋白样品中加入适量浓缩的SDS-PAGE蛋白上样缓冲液。例如2X或5X的SDS-PAGE蛋白上样缓冲液。使用5X的SDS-PAGE蛋
白上样缓冲液可以减小上样体积,在相同体积的上样孔内可以上样更多的蛋白样品。5X的SDS-PAGE蛋白上样缓冲液可以参考相关文献资料配制,也可以使用碧云天生产的SDS-PAGE蛋白上样缓冲液(5X)。
Ø 100℃或沸水浴加热3-5分钟,以充分变性蛋白。
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  • 丸子妹 (2011-8-20 11:24:15)

    3) 上样与电泳
    Ø 冷却到室温后,把蛋白样品直接上样到SDS-PAGE胶加样孔内即可。

    Ø 为了便于观察电泳效果和转膜效果,以及判断蛋白分子量大小,最好使用预染蛋白质分子量标准。

    Ø 电泳时通常推荐在上层胶时使用低电压恒压电泳,而在溴酚蓝进入下层胶时使用高电压恒压电泳。对于Bio-Rad的标准电泳装置
    或类似电泳装置,低电压可以设置在80-100V,高电压可以设置在120V左右。SDS-PAGE可以采用普通的电泳仪就可以满足要求,
    也可以采用碧云天的多功能电泳仪(带定时)。为了电泳方便起见,也可以采用整个SDS-PAGE过程恒压的方式,通常把电压设置在
    100V,然后设定定时时间为90-120分钟。设置定时可以避免经常发生的电泳过头。

    Ø 通常电泳时溴酚蓝到达胶的底端处附近即可停止电泳,或者可以根据预染蛋白质分子量标准的电泳情况,预计目的蛋白已经被适
    当分离后即可停止电泳。

    3. 转膜(Transfer)

    Ø 我们推荐在Western实验中选用PVDF膜。硝酸纤维素膜(NC膜)也可以使用,但硝酸纤维素膜比较脆,在操作过程中特别是用镊子
    夹取等过程中容易裂开。膜的使用请参考生产商的推荐使用步骤。

    Ø 通常如果使用Bio-Rad的标准湿式转膜装置,可以设定转膜电流为300-400mA,转膜时间为30-60分钟。也可以在15-20mA转膜过
    夜。转膜时也可以使用碧云天的多功能电泳仪(带定时)。具体的转膜时间要根据目的蛋白的大小而定,目的蛋白的分子量越大,
    需要的转膜时间越长,目的蛋白的分子量越小,需要的转膜时间越短。

    Ø 在转膜过程中,特别是高电流快速转膜时,通常会有非常严重的发热现象,最好把转膜槽放置在冰浴中进行转膜。

    Ø 转膜的效果可以观察所使用的预染蛋白质分子量标准,通常分子量最大的1-2条带较难全部转到膜上。转膜的效果也可以用丽春
    红染色液对膜进行染色,以观察实际的转膜效果。也可以用考马斯亮蓝快速染色液对完成转膜的SDS-PAGE胶进行染色,以观察蛋
    白的残留情况。
  • 丸子妹 (2011-8-20 11:24:43)

    . 封闭(Blocking)

    Ø 转膜完毕后,立即把蛋白膜放置到预先准备好的Western洗涤液中,漂洗1-2分钟,以洗去膜上的转膜液。从转膜完毕后所有的步
    骤,一定要注意膜的保湿,避免膜的干燥,否则极易产生较高的背景。

    Ø 用微型台式真空泵吸尽洗涤液,加入Western封闭液,在摇床上缓慢摇动,室温封闭60分钟。对于一些背景较高的抗体,可以在
    4℃封闭过夜。在整个Western过程中我们推荐使用碧云天的侧摆摇床,侧向摆动速度比较缓慢,而且也容易让溶液覆盖蛋白膜。

    5. 一抗孵育(Primary antibody incubation)

    Ø 参考一抗的说明书,按照适当比例用Western一抗稀释液稀释一抗。

    Ø 用微型台式真空泵吸尽封闭液,立即加入稀释好的一抗,室温或4℃在侧摆摇床上缓慢摇动孵育一小时。如果一抗孵育一小时效果
    不佳,可以在4℃缓慢摇动孵育过夜。

    Ø 回收一抗。加入Western洗涤液,在侧摆摇床上缓慢摇动洗涤5-10分钟。吸尽洗涤液后,再加入洗涤液,洗涤5-10分钟。共洗涤
    3次。如果结果背景较高可以适当延长洗涤时间并增加洗涤次数。

    6. 二抗孵育(Secondary antibody inucubation)

    Ø 参考二抗的说明书,按照适当比例用Western二抗稀释液稀释辣根过氧化物酶(HRP)标记的二抗。

    Ø 用微型台式真空泵吸尽洗涤液,立即加入稀释好的二抗,室温或4℃在侧摆摇床上缓慢摇动孵育一小时。

    Ø 回收二抗。加入Western洗涤液,在侧摆摇床上缓慢摇动洗涤5-10分钟。吸尽洗涤液后,再加入洗涤液,洗涤5-10分钟。共洗涤
    3次。如果结果背景较高可以适当延长洗涤时间并增加洗涤次数。
  • 丸子妹 (2011-8-20 11:24:43)

    . 封闭(Blocking)

    Ø 转膜完毕后,立即把蛋白膜放置到预先准备好的Western洗涤液中,漂洗1-2分钟,以洗去膜上的转膜液。从转膜完毕后所有的步
    骤,一定要注意膜的保湿,避免膜的干燥,否则极易产生较高的背景。

    Ø 用微型台式真空泵吸尽洗涤液,加入Western封闭液,在摇床上缓慢摇动,室温封闭60分钟。对于一些背景较高的抗体,可以在
    4℃封闭过夜。在整个Western过程中我们推荐使用碧云天的侧摆摇床,侧向摆动速度比较缓慢,而且也容易让溶液覆盖蛋白膜。

    5. 一抗孵育(Primary antibody incubation)

    Ø 参考一抗的说明书,按照适当比例用Western一抗稀释液稀释一抗。

    Ø 用微型台式真空泵吸尽封闭液,立即加入稀释好的一抗,室温或4℃在侧摆摇床上缓慢摇动孵育一小时。如果一抗孵育一小时效果
    不佳,可以在4℃缓慢摇动孵育过夜。

    Ø 回收一抗。加入Western洗涤液,在侧摆摇床上缓慢摇动洗涤5-10分钟。吸尽洗涤液后,再加入洗涤液,洗涤5-10分钟。共洗涤
    3次。如果结果背景较高可以适当延长洗涤时间并增加洗涤次数。

    6. 二抗孵育(Secondary antibody inucubation)

    Ø 参考二抗的说明书,按照适当比例用Western二抗稀释液稀释辣根过氧化物酶(HRP)标记的二抗。

    Ø 用微型台式真空泵吸尽洗涤液,立即加入稀释好的二抗,室温或4℃在侧摆摇床上缓慢摇动孵育一小时。

    Ø 回收二抗。加入Western洗涤液,在侧摆摇床上缓慢摇动洗涤5-10分钟。吸尽洗涤液后,再加入洗涤液,洗涤5-10分钟。共洗涤
    3次。如果结果背景较高可以适当延长洗涤时间并增加洗涤次数。
  • 丸子妹 (2011-8-20 11:25:08)

    7. 蛋白检测(Detection of proteins)

    Ø 参考相关说明书,使用BeyoECL, Western 荧光检测试剂等ECL类试剂来检测蛋白。
    Ø 洗片时可以使用X光片自动洗片机。如果没有自动洗片机,可以用显影定影试剂盒自行配制显影液和定影液进行手工洗片。


    8. 膜的重复利用(Membrane recovery)

    Ø 如果蛋白样品非常宝贵,可以使用Western一抗二抗去除液处理蛋白膜,以重复利用蛋白膜。

    Western的几点经验
    1.用脱脂奶粉封闭的效果不一定比用BSA差,不过我们试过几种奶粉,有一些奶粉不太适合.推荐使用的奶粉:雀巢高钙奶粉,多力精低脂奶粉.一般国产的奶粉的颗粒比较大,不太容易溶解.
    2.关于三名治:本人以前做时花很多时间在防止短路上,现在我做的时候根本没有剪齐,最主要的是赶气泡,这是关键的关键,其实转膜的原理是电流的单向流动,现在的好多公司的转膜装置的电极是一个平面,所以不用担心短路的.(不信的可以试试!!)
    3.关于转膜时的温度:转膜时的温度比较重要,最好保持在10度以下,可以用冰浴(Pharmacia的转膜装置),也可以在转膜液中放入合适的事先准备的冰袋(-70度>3小时)(Bio-Rad),这样既可以降温又可以节约Buffer.
    4.关于转膜电流和时间:一般转膜的电流在200mA-400mA之间时间为1小时,大片段的>50KD的可以选用350mA,小片段的可以用250mA,不过本人觉得上述电流均能很好的把大部分蛋白转过去.
    5.关于反复标记和再标记:一张膜上可以同时标记很多抗体,但要注意,一般在两个目的蛋白相差在5KD以上的,最好先后两个抗体是不同的二抗.在两个目的片段相差小于5KD时,就需要经过处理,再标记了(Re-Blot),有些公司有再标记的现成试剂,不过比较贵,最简单的方法是:ddH2O洗5分钟,0.2MNaOH5分钟,再用ddH2O5分钟*3次,然后可以再标记了.要做多个抗体的膜\的选择,最好用PVDF或教坚固的,推荐用Amsham的Hybond-P,Hybond-Extra.本人最多在一张膜上做个10个不同的抗体.
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