pcr产物纯化步骤---加入了细节和体会

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pcr产物纯化步骤---加入了细节和体会
pcr产物纯化步骤---加入了细节和体会 [转自 丁香园论坛]


在下第一次专业贴,请尊敬的斑竹及各位通道指教。
原创声明:由于个人觉得pcr纯化试剂盒的说明个别地方不够详细,同时也向同实验室的师姐请教了些心得,把本人最近做完纯化实验后的体会与大家分享,希望能让将来有此需要的人得到简单的帮助。。。。。。。。。。。。。如有雷同,实属巧合,谢谢
PCR产物纯化步骤(biomega纯化试剂盒)
1、准备与纯化样品个数相同的德ep管(大),分别标记
2、向每个管中加入50X5ul的GC buffer (片段小于200bp的GC:pcrDNA=5:1 大于200bp的病例为2:1)
3、将pcr产物(50ul)全部吸出加入到相对应的ep管中,混匀后涡旋离心
4、准备好离心柱(分为两部分,请做好双重标记)
5、将混匀的液体加入到离心柱中。离心 13000g,1min
6、将柱子取出,倒掉管中液体,再套回柱子备用(产物中的DNA此时全部附于离心柱的过滤筛上)
7、向每个管中加入500ul wash buffer,放入离心机,13000g,1min后重复步骤6.
8、再向管中加入500ul wash buffer,放入离心机,13000g,1min后重复步骤6.
9、将离心柱的盖子打开(让wash buffer中的酒精挥发)和套管一起放入离心机,16000g,4min(去除干净wash buffer)
10、准备要用来收集纯化样品的ep管(大),对应标记。
11、将离心柱的管芯取出,套入相应的ep管,向离心柱中心的白膜(过滤筛)上滴加30ul的灭菌纯水or Elution buffer,室温放置3min(让DNA溶解于溶液中,便于洗脱)
11、将离心柱盖好,连同ep管一同放入离心机(此时ep管的管是打开的),13000g,1min。
12、取出整个套管,打开离心柱盖子,向中心虑筛处滴加20ul灭菌纯水or Elution buffer后室温放置3min,重复11步骤。
13、取出套管,此时大ep管中应当收集了50ul的纯化DNA产物,丢弃柱子,4°保存DNA样本备用。
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最新回复

  • =菓子= (2011-8-23 15:07:42)

    沙发自己坐。。。。。。。。。。。。呵呵
  • HOT兔 (2011-8-23 15:08:29)

    正好,正准备做呢。biomega的试剂盒贵不?国产的效果怎么样?
  • 格格巫 (2011-8-23 15:08:58)

    biomega的试剂盒应该算是中等价位的了,性价比相对还可以吧,我买的kit是可行50次反应的,单价119.66元RMB,另加税率17%,我买了两盒,一共280元。也即是280元100个反应。不知这样您是否清楚了。国产的,我们实验室的师姐不建议用,所以没有太多经验,期待有经验的加入讨论,谢谢
  • 不懂 (2011-8-23 15:09:52)

    那个图片很专业 哈哈
  • 大仙 (2011-8-23 15:10:24)

    不错,谢谢了。
  • =菓子= (2011-8-23 15:11:28)

    呵呵,不客气了。最近还在重复以上的简单劳动,不管是大于200bp和小于200bp的片段都能得到理想的纯化结果。请问,可以纯化的最小片段应该是多少啊?说明书上没有写的。不知哪位有没有经验!!
  • =菓子= (2011-8-23 15:14:17)

    imp83 DXYer的问题;我个人觉得,纯化过程中GC buffer的量是否完全按照说明书的比例是不用那么精确的,一点点的偏差不会有太大影响。但是我曾今试过误将5 volume的GC加入大于200bp长度的片段纯化过程。虽然片段只有200多一点,但是收集到的产物浓度确实有可能下降(我是通过纯化前后等体积产物琼脂糖电泳条带的亮度来判断的,不知是否准确)。还有DNAwash buffer,量多点少点,如500只加了450我觉得都不会影响太大。其实跟洗衣服放多少水道理应该一样!  
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