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实验中的疑问
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发表于: 2011-9-20 15:36 作者: SOS 来源: 分析测试百科网
查看完整版本请点击这里:
实验中的疑问
实验中的疑问[转载]
本人两个多月以来在rna提取工作中历经曲折,目前毫无结果,不禁产生疑问。请教各位前辈一般实验室条件下 rna可以提取出来吗?
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实验中的疑问
我也来说两句
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#甜#
(2011-9-20 15:36:40)
常规工作,怎么不可以。你说一下你的实验过程,大家帮你判断一下。
8黑眼圈8
(2011-9-20 15:37:01)
提RNA的新手大多有这样的经历,如果经费比较充足的话还是买KIT比较省事的,不用将宝贵的时间花在这样的纯粹的体力劳动上了。将空出来的时间花在上DXY上与老哥哥老姐姐们交流交流一准会事半功倍。
+田田+
(2011-9-20 15:37:25)
我刚做完RNA提取,我们实验室条件也不好,没有专门的实验室,没有专门的加样器,大家都在一个实验室,但我一般都在晚上提,这样可以避免污染。另外,在处理所有实验用品的时候,一定要仔细、小心。我不知道你的实验条件,我做的结果还可以。可能的话,你把实验记录发一份看一下,我们共同探讨。
萌芽
(2011-9-20 15:37:59)
只要标本保存的好,量充分(每次约50毫克)。你肯定可以提出RNA来。我曾经故意用没有经DEPC处理过的吸头EP管来提取RNA,结果一样好。室温放置一夜后再跑电泳也只有少许降解。我的经验是,关键标本要保存的好,提取的过程就算有部分降解,拿来做RT-PCR时绝对没问题的。
晶晶亮
(2011-9-20 15:38:28)
用KIT 保险点.别舍不得这钱,可省很多时间.QIGEN的很不错,提RNA一两小时可搞定.
wawa
(2011-9-20 15:39:29)
非常感谢各位前辈的热心关怀与指导!
下面是我的实验方案:所有的器具,所用试剂均按照标准进行灭酶,灭菌处理。(0.2%DEPC浸泡12小时,玻璃器具180度干烤一夜)。
从霉菌中提取RNA,菌体收集后-70度冰箱中保存。
用Takara kit提取,菌体量用25mg(量太多裂解液裂解效果感觉不好)
最好的一次结果OD260/OD280=1.4左右,甲醛变性凝胶电泳结果无条带出现。
实验室条件也不好,没有专门的实验室,加样器,电泳仪专用,其他仪器大家公用。
恳请各位长辈给予一定的指导。
岸上的鱼
(2011-9-20 15:39:59)
不知道你用的是什么裂解液?
有一些标本由于结构的特殊(如结核杆菌细胞壁含有大量的脂质),所以要应用一些特殊的裂解液,我们实验室有这方面的专门材料,但我记的不太清楚了,明天回去会帮你查查。
橘子水儿
(2011-9-20 15:40:40)
我提total RNA是用invitrogen的TRizol从组织中提的,方法如下: 我怀疑你的菌体裂解不够完全.
血吸虫成虫总RNA的提取
称取500mg(湿重)成虫,按试剂盒说明进行总RNA的提取,得300µl RNA溶液。按1:100的比例稀释后,测其A260 和A280并计算纯度和含量。
1) 将500mg成虫放入玻璃匀浆器内,加入5ml 4℃的TRIzol试剂,于冰上匀浆10min;
2) 分离:将匀浆好的样品转移到3个EP管中,放15~30℃孵育5min,每管再加0.5ml氯仿,用力振荡15sec,放15~30℃孵育3min,2~8℃ 12000g离心15min;
3) RNA沉淀:将上层液相转移到3个新EP管中,每管加0.5ml异丙醇混匀,放15~30℃孵育10 min,2~8℃ 12000g离心10min;
4) RNA洗涤:去上清,每管加1ml 75%的乙醇,用涡悬混匀器振荡,然后2~8℃,7500g离心5min;
5) RNA溶解:短暂干燥RNA后,每管加100µl DEPC处理的去离子水溶解RNA;
6) 将RNA按1:100的比例稀释后,用紫外分光光度计测其A260 和A280计算纯度和含量。以及下面公式分别计算RNA的纯度和含量:
[RNA]=A260×稀释度/25(μg/μl)
(如果获得的总RNA量<50μg,则不应进行以下步骤——从总RNA中分离polyA+RNA。
SOS
(2011-9-20 15:41:12)
我得裂解液是catrimox takara的试剂,我又做了几次,改变菌体量等参数,能指导一下,操作中÷的一些关键步骤(你们实际的经验)
SOS
(2011-9-20 15:41:12)
我得裂解液是catrimox takara的试剂,我又做了几次,改变菌体量等参数,能指导一下,操作中÷的一些关键步骤(你们实际的经验)
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#甜# (2011-9-20 15:36:40)
8黑眼圈8 (2011-9-20 15:37:01)
+田田+ (2011-9-20 15:37:25)
萌芽 (2011-9-20 15:37:59)
晶晶亮 (2011-9-20 15:38:28)
wawa (2011-9-20 15:39:29)
下面是我的实验方案:所有的器具,所用试剂均按照标准进行灭酶,灭菌处理。(0.2%DEPC浸泡12小时,玻璃器具180度干烤一夜)。
从霉菌中提取RNA,菌体收集后-70度冰箱中保存。
用Takara kit提取,菌体量用25mg(量太多裂解液裂解效果感觉不好)
最好的一次结果OD260/OD280=1.4左右,甲醛变性凝胶电泳结果无条带出现。
实验室条件也不好,没有专门的实验室,加样器,电泳仪专用,其他仪器大家公用。
恳请各位长辈给予一定的指导。
岸上的鱼 (2011-9-20 15:39:59)
有一些标本由于结构的特殊(如结核杆菌细胞壁含有大量的脂质),所以要应用一些特殊的裂解液,我们实验室有这方面的专门材料,但我记的不太清楚了,明天回去会帮你查查。
橘子水儿 (2011-9-20 15:40:40)
血吸虫成虫总RNA的提取
称取500mg(湿重)成虫,按试剂盒说明进行总RNA的提取,得300µl RNA溶液。按1:100的比例稀释后,测其A260 和A280并计算纯度和含量。
1) 将500mg成虫放入玻璃匀浆器内,加入5ml 4℃的TRIzol试剂,于冰上匀浆10min;
2) 分离:将匀浆好的样品转移到3个EP管中,放15~30℃孵育5min,每管再加0.5ml氯仿,用力振荡15sec,放15~30℃孵育3min,2~8℃ 12000g离心15min;
3) RNA沉淀:将上层液相转移到3个新EP管中,每管加0.5ml异丙醇混匀,放15~30℃孵育10 min,2~8℃ 12000g离心10min;
4) RNA洗涤:去上清,每管加1ml 75%的乙醇,用涡悬混匀器振荡,然后2~8℃,7500g离心5min;
5) RNA溶解:短暂干燥RNA后,每管加100µl DEPC处理的去离子水溶解RNA;
6) 将RNA按1:100的比例稀释后,用紫外分光光度计测其A260 和A280计算纯度和含量。以及下面公式分别计算RNA的纯度和含量:
[RNA]=A260×稀释度/25(μg/μl)
(如果获得的总RNA量<50μg,则不应进行以下步骤——从总RNA中分离polyA+RNA。
SOS (2011-9-20 15:41:12)
SOS (2011-9-20 15:41:12)
实验中的疑问