【求助】质谱样品为经过SDS-PAGE电泳之后切下来的片段

最近在做原核,表达出了一个蛋白,大小与目的蛋白预测大小相符,本身连接上了HIS标签,经过镍柱纯化,成功挂柱洗脱。于是准备进行蛋白质谱鉴定,想进一步确定的确为目的蛋白。质谱样品为经过SDS-PAGE电泳之后切下来的片段,从制胶到最后切胶的过程中一直佩戴了手套,但是最终的鉴定结果竟然是角蛋白,这让我想当迷惑,找不出原因,希望路过的大大们可以提点一下,多谢各位啦
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最新回复

  • malong (2015-11-27 13:19:55)

    楼主你好 我也有同样的问题 跟你一模一样 请问知道是啥原因了吗 怎么解决的呢
  • yuanyuan (2015-11-27 13:20:16)

    目前还不知道原因,待解决中
  • 无怨无悔 (2015-11-27 13:20:36)

    楼主参考下这个 也许能找到答案 cuturl('http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=7467723&fpage=1')
  • 灵魂 (2015-11-27 13:20:57)

    做质谱角蛋白污染很难控制,带手套只能防止手上的角蛋白污染,但如果手套换的不勤快,在反复摘手套的过程中有相当大的可能性把手套外表污染,进而污染样品。
    另外还有头屑的角蛋白也容易污染样品
    不过表达纯化的样品就算有角蛋白污染也不至于检测不到目的蛋白
    如果你的结果只有角蛋白的话,建议看看是不是表达质粒有问题,如果移码了,就很可能检测不到
  • yayayu (2015-11-27 13:21:16)

    第一看要看一下你跑的胶,目的蛋白的量怎么样,如果本身条带很浅很细,那很容易受到污染蛋白的影响,质谱鉴定过程中是很难保证完全没有非样品信号,有的非样品峰如角蛋白的峰、酶自切峰还可以作为内标校准峰,所以并不是什么坏事情。质谱鉴定时的信号本身就是一个此消彼长的过程,如果你的目的蛋白的含量高就会把污染蛋白肽段的信号压制下去,获得更多的样品信号峰,从而获得更可信的鉴定结果。所以如果发现目标蛋白量小,就加大上样量。
    第二酶解过程中的影响,如果你的酶解过程有问题,你再多的样品量也没有用。如果酶没有进入胶内,没有切到样品蛋白,那自然就只能切到胶外的污染角蛋白。所以要仔细检查酶解过程有没有闪失,这个是关键。
    希望对你有帮助,good luck
  • xiaoxiaojinglin (2015-11-27 13:21:37)

    在整个实验过程中不仅要带无粉乳胶手套,还要戴口罩,最好戴帽子,另外,检测你的试剂有没有污染,切胶的一套工具用超纯水洗干净。