【求助】现在我这张二级质谱图有问题吗

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【求助】现在我这张二级质谱图有问题吗
初次接触质谱解析,做2条2肽,用安捷伦Q-TOF MS/MS做,一切都挺好,仪器状态也不错,可出来的二级质谱图把我整郁闷了,附图,有下面几个问题
1、都说肽类y系列和b系列离子碎片是主要的,为什么我的只有y或b离子呢,而且还是y''或b''。
2、没有看见y或b离子,却有y-co2或b-co2离子。这有什么问题吗?
3、311那个,277.1077真心没法解释,质谱分析提示311.1238是C14H18N2O6加氢峰,247.1066是C13H15N2O3
4、现在我这张二级质谱图有问题吗?会不会我推错了,感觉分子式一定正确,不知道哪出了问题。
当前TOF状态相当好,走标品出来的精确质量非常准,推出的分子式也很准。望大侠指导。
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  • QQ爱 (2015-12-01 11:11:04)

    Sequence: EL,   pI: 3.99987
    Fragment Ion Table, monoisotopic masses
    Seq    #       B            Y         # (+1)
      E     1    130.05046    261.14509    2
      L     2    243.13453    132.10250    1
    Sequence: EY,   pI: 3.99987
    Fragment Ion Table, monoisotopic masses
    Seq    #       B            Y         # (+1)
      E     1    130.05046    311.12436    2
      Y     2    293.11379    182.08176    1
    cuturl('http://db.systemsbiology.net/proteomicsToolkit/FragIonServlet.html')
  • 冰激凌 (2015-12-01 11:11:24)

    这款软件非常实用,非常感谢!
    还想问您一下这款软件查出来的结果什么意思呢,怎么所有离子碎片都归属分类了,如197和247这种离子是母离子脱水脱co2产生的也算是b型离子吗?
    x,y,z,a,b,c不明白是怎么回事了,我一直理解是肽键三个断裂处的不同归属,对吗?
    还想问一下一样的肽,不同的连接质谱会有什么区别吗,如YE或EY,现在看的话只是YE比EY多出一些离子来,其它没有什么区别,我样品里边α,γ谷氨酸肽都有。
    真心初学者,望指点啊
  • 冰激凌 (2015-12-01 11:11:45)

    Fragments will only be detected if they carry at least one charge. If this charge is retained on the N terminal fragment, the ion is classed as either a, b or c. If the charge is retained on the C terminal, the ion type is either x, y or z.
    cuturl('http://www.matrixscience.com/help/fragmentation_help.html')
    Sequence: EY
    Seq    #       B            Y         # (+1)
      E     1    130.05046    311.12436    2
      Y     2    293.11379    182.08176    1
    Sequence: YE
    Seq    #       B            Y         # (+1)
      Y     1    164.07120    311.12436    2
      E     2    293.11379    148.06103    1
    EY和YE的b,y离子不一样的。但是,实际情况很有可能是,因为碎裂的很多,还会出来很多其它的碎片峰,lz只能把所有比较显著的峰都给出合理的裂解途径了,才能证明它的连接就是你所希望的连接。。
    如果两种同分异构体混在一起了,那这就不是质谱能解决的范围了,至少要在LC能分开了才好定性。
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