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【求助】现在我这张二级质谱图有问题吗
初次接触质谱解析,做2条2肽,用安捷伦Q-TOF MS/MS做,一切都挺好,仪器状态也不错,可出来的二级质谱图把我整郁闷了,附图,有下面几个问题【求助】现在我这张二级质谱图有问题吗
1、都说肽类y系列和b系列离子碎片是主要的,为什么我的只有y或b离子呢,而且还是y''或b''。
2、没有看见y或b离子,却有y-co2或b-co2离子。这有什么问题吗?
3、311那个,277.1077真心没法解释,质谱分析提示311.1238是C14H18N2O6加氢峰,247.1066是C13H15N2O3
4、现在我这张二级质谱图有问题吗?会不会我推错了,感觉分子式一定正确,不知道哪出了问题。
当前TOF状态相当好,走标品出来的精确质量非常准,推出的分子式也很准。望大侠指导。
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【求助】现在我这张二级质谱图有问题吗
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最新回复
QQ爱 (2015-12-01 11:11:04)
Fragment Ion Table, monoisotopic masses
Seq # B Y # (+1)
E 1 130.05046 261.14509 2
L 2 243.13453 132.10250 1
Sequence: EY, pI: 3.99987
Fragment Ion Table, monoisotopic masses
Seq # B Y # (+1)
E 1 130.05046 311.12436 2
Y 2 293.11379 182.08176 1
cuturl('http://db.systemsbiology.net/proteomicsToolkit/FragIonServlet.html')
冰激凌 (2015-12-01 11:11:24)
还想问您一下这款软件查出来的结果什么意思呢,怎么所有离子碎片都归属分类了,如197和247这种离子是母离子脱水脱co2产生的也算是b型离子吗?
x,y,z,a,b,c不明白是怎么回事了,我一直理解是肽键三个断裂处的不同归属,对吗?
还想问一下一样的肽,不同的连接质谱会有什么区别吗,如YE或EY,现在看的话只是YE比EY多出一些离子来,其它没有什么区别,我样品里边α,γ谷氨酸肽都有。
真心初学者,望指点啊
冰激凌 (2015-12-01 11:11:45)
cuturl('http://www.matrixscience.com/help/fragmentation_help.html')
Sequence: EY
Seq # B Y # (+1)
E 1 130.05046 311.12436 2
Y 2 293.11379 182.08176 1
Sequence: YE
Seq # B Y # (+1)
Y 1 164.07120 311.12436 2
E 2 293.11379 148.06103 1
EY和YE的b,y离子不一样的。但是,实际情况很有可能是,因为碎裂的很多,还会出来很多其它的碎片峰,lz只能把所有比较显著的峰都给出合理的裂解途径了,才能证明它的连接就是你所希望的连接。。
如果两种同分异构体混在一起了,那这就不是质谱能解决的范围了,至少要在LC能分开了才好定性。
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