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【求助】用拉曼测定了鸭肉盐溶蛋白的二级结构
用拉曼测定了鸭肉盐溶蛋白的二级结构,看到很多人采用二阶导数结合去卷积后曲线拟合的方法进行分析,有几点疑惑,不知道我的处理对不对,希望大家帮忙解答:【求助】用拉曼测定了鸭肉盐溶蛋白的二级结构
1 平滑问题:我把1600-1700区间进行平滑后,求二阶导数,通过二阶导数的峰谷确定峰的数量,控制在9-12,以此确定平滑程度,不知道这样平滑对不对,还有就是二阶导出得到的峰的位置是不是和曲线拟合后的各个峰位置一样呢?
2 去卷积拟合问题:我在peakfit里边并没有看到可以去卷积,只是看到拟合方法第三个是基于高斯去卷积的,大家所谓的去卷积再拟合是不是指这个呢?里边的去卷积参数width 和filter怎么设置呢?我用omnic可以进行去卷积,但是导出来的数据点不太好,好像不能用它继续进行分峰
3 应用二阶导数曲线拟合:我用peakfit里面的方法二-二阶导数法进行曲线拟合,通过改变smoothing参数来控制峰的数量与二阶导数一致,这样对不?但是在多次拟合的过程中结果变化很大,峰位也逐渐变化跟二阶导数的不一样,图1-3是在多次拟合时图的变化,r2都达到0.999……,interation一定要变成7吗?看到别人的结果都像图4一样,感觉很均匀很好看。不知道我的处理是不是有什么问题?
希望大家能解答一二,谢谢!
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最新回复
女儿情 (2015-12-03 12:04:39)
我真是纯种新手呢,对于这个peakfit的功能及用法真的不了解,搜了网上的教程,也不够详细,当然身边也没有人会玩这个软件。你要是不嫌弃的话,我们可以多交流,或者你能否说一下这个软件你是咋学的?我看着那个全英文的说明书都快看哭了。真真是十分感谢啊!
女儿情 (2015-12-03 12:05:04)
8899 (2015-12-03 12:05:26)
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