【求助】我想做蛋白质与小分子化合物

我想做蛋白质与小分子化合物（潜在抑制剂）相互作用的分析，确定他是底物类似物还是非底物类似物。
2013年发表的两篇文章使用Electrospray ionization mass spectrometry (ESMS)方法，使用Qtof-micro MS instrument (Waters Corp.,Milford, MA).仪器来进行检测。文章名字：“New Classes of Alanine Racemase Inhibitors Identified by
High-Throughput Screening Show Antimicrobial Activity against Mycobacterium tuberculosis”。
我们学校现有的质谱仪有：1电感偶合等离子体质谱仪，X Series 2 ICP-MS；
2高效液相色谱-质谱联用仪，LTQXL。
请问我这两种质谱能用哪一个来做呢？本人对质谱不是很懂，只用过几次TOF-ms。
提前谢谢各位的帮助啦！