【求助】chimera 检查嵌合体

最新回复

• wawa (2016-1-14 14:29:42)

  直接不是可以用网页版的Bellerophon 检测chimeras嘛，很方便的，网址
  http://comp-bio.anu.edu.au/bellerophon/bellerophon.pl
  

• seagate (2016-1-14 14:30:39)

  前辈啊，现在这个网页不能用了，还有其他的方法吗？最好是既能检测又能在检测后去除嵌合体序列的，我做的是环境样品的16S的
  

• wawa (2016-1-14 14:31:03)

  QUOTE:

  原帖由 seagate 于 2016-1-14 14:30 发表
  前辈啊，现在这个网页不能用了，还有其他的方法吗？最好是既能检测又能在检测后去除嵌合体序列的，我做的是环境样品的16S的
  

  可以用呀，为什么不能？我点开依然可以用。检测出来的嵌合体数据库和软件很多，这个是免费的网站，另外好像没有说有检测出来还能帮你剔除的，自己剔除就好。

• wawa (2016-1-14 14:34:22)

  请问这个网站怎么用啊，我刚接触这个，可以教教我们，加我qq可以么，14292161

• finger (2016-1-14 14:35:45)

  请问你知道怎么用Bellerophon了吗，如果知道能不能向你请教下啊

• 49888 (2016-1-14 14:42:33)

  Usearch软件的uchime功能可以做chimera check，我们课题组发高通量测序的SCI都用这个软件做chimera check，速度很快，对电脑配置要求很低，windows、linux都能用。
  
  原理：
  http://drive5.com/usearch/manual/uchime_algo.html
  
  软件下载：
  http://www.drive5.com/usearch/download.html
  
  说明及命令使用方法：
  1.带reference的方法（推荐！使用需下载一个gold文件，下面链接里有）
  http://drive5.com/usearch/manual/uchime_ref.html
  2. denovo方法：
  http://drive5.com/usearch/manual/uchime_denovo.html

• rfv (2016-1-14 14:49:01)

  Usearch软件的uchime功能可以做chimera check，我们课题组发高通量测序的SCI都用这个软件做chimera check，速度很快，对电脑配置要求很低，windows、linux都能用。
  
  原理：
  http://drive5.com/usearch/manual/uc ...
  
  ==========================================================
  
  你好，我下载好了安装的时候怎么出现程序框，一闪，然后就没有然后了