查看完整版本请点击这里:
[求助]哪位战友能帮忙用灰度分析软件分析一下PCR结果?
[求助]哪位战友能帮忙用灰度分析软件分析一下PCR结果? [求助]哪位战友能帮忙用灰度分析软件分析一下PCR结果?
下面是我的PCR结果,但是好些条带我的BANDSCAN软件根本扫不出来,哪位战友能帮忙用其他的权威灰度分析软件分析一下PCR结果?比如各带的总灰度值, 目的基因与B-ACTIN的比值, 差异度分析, 我在这里先多谢了!每块胶各有两列带,跑在前面的是B-ACTIN, 跑在后面的是目的基因,调整亮度和对比度可以看的清楚些.
查看完整版本请点击这里:
[求助]哪位战友能帮忙用灰度分析软件分析一下PCR结果?
[求助]哪位战友能帮忙用灰度分析软件分析一下PCR结果?
59937902.jpg
最新回复
mod=8048 (2011-10-10 17:25:12)
韩梅梅 (2011-10-10 17:25:35)
请按照下述的样式准备图片(附图例):
1、照片尽可能的大(注意不要包含无关的黑被景),这样包含的原始信息最多;
2、Marker靠在左排;
3、加样孔放在上方;
4、如有可能,将图像亮度、对比度调到最佳,并反转显示(Invert display)。
39996392.png
韩梅梅 (2011-10-10 17:26:05)
供您参考。
76540009.png
mod=8048 (2011-10-10 17:26:57)
1 关于总灰度值的疑问, 怎么我用BANDSCAN扫描后的结果一般为三个值,
PEAK GREY; TOTAL GREY, AREA 我就用总灰度的比值来定量,其值一般如下例所示:
2673847 1782073
3281621 3503883
0.8148 0.5086
您提供的QUANTITY 定量的值,比如B1/1为1.3897/37.787,值约为0.0349,我对QUANTITY软件没有用过,所以不明白这个定量的值是不是总灰度值,二者的比值这么低说明什么问题?您一般RT-PCR半定量,值一般为多少?
2 对于QUANTITY这个软件的灵敏度我真是很佩服,BANDSCAN相比之下就逊色多了,
请问您的这个软件在哪里可以下载***版的?
mod=8048 (2011-10-10 17:26:57)
1 关于总灰度值的疑问, 怎么我用BANDSCAN扫描后的结果一般为三个值,
PEAK GREY; TOTAL GREY, AREA 我就用总灰度的比值来定量,其值一般如下例所示:
2673847 1782073
3281621 3503883
0.8148 0.5086
您提供的QUANTITY 定量的值,比如B1/1为1.3897/37.787,值约为0.0349,我对QUANTITY软件没有用过,所以不明白这个定量的值是不是总灰度值,二者的比值这么低说明什么问题?您一般RT-PCR半定量,值一般为多少?
2 对于QUANTITY这个软件的灵敏度我真是很佩服,BANDSCAN相比之下就逊色多了,
请问您的这个软件在哪里可以下载***版的?
韩梅梅 (2011-10-10 17:27:19)
至于,对于定量结果的评价,数值和比值都不重要,这些都是相对数据,没有实际意义,附图是我对这些数据的应用实例,供您参考。
该软件在园内已经提供较完美的***版,我已经测试过,效果还不错,建议下载后用一把试试。
链接为:
cuturl('http://www.dxy.cn/bbs/thread/1092774')
以及最新的:
cuturl('http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=10&id=1019979&sty=1&tpg=1&age=0')
Good Luck!
72660958.jpg
百分比 (2011-10-10 17:28:08)
韩梅梅 (2011-10-10 17:28:37)
但是,对于图像存贮来说,应首先考虑存为Tiff格式,其次为Bmp格式,这两种格式可以最大限度的保存原始资料的图像信息,其他的格式都为有损压缩,有可能会严重影响图形的清晰度和分辨率,所以也会影响到最终定量结果的准确性。
仅供参考,请根据自己的具体情况择优采取各种不同的图像存储格式。
04906 (2011-10-10 17:29:18)
供您参考。
==========================================================
能简要说说过程吗?比如怎么选中条带方框的?怎么得到下面的数据的?谢谢
红豆冰 (2011-10-10 17:29:45)
韩梅梅 (2011-10-10 17:30:22)
==============================================================================================================
您好:
下载、安装Quantity One***版本,详细阅读帮助文件(最好看PDF版本)中的Volume一章,我的全部技术都是从这一章自学来的,仅花一天工夫!
相信您也一定能学好,然后试着分析几个图像,应用过程中有什么问题咱们再讨论,这样可能比我纸上谈兵要好得多,您说呢?
等您的好消息
[求助]哪位战友能帮忙用灰度分析软件分析一下PCR结果?