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【求助】dgge最后一次分离切胶后用不带GC夹子引物...
又来请教大家了。如题还是PCR扩增不出,之前用于做DGGE的pcr用B968F-GC和B1401R效果很好,长度不到500bp,现在切完胶要测序了,用B968F扩不出来了,它与B968F-GC的序列是一样的啊,为什么出不来呢?????【求助】dgge最后一次分离切胶后用不带GC夹子引物...
我试了做引物浓度梯度,模板浓度梯度,退火温度梯度,降落PCR也试过了,都不行,不带GC夹的引物几乎都扩出来了!!
今天用DNA模板做不带GC夹子引物的扩增也出不来,我就搞不明白了,引物序列是一样的,怎么这就结合不上去了!!
大家快帮我分析分析吧~~~~或者给我推荐几篇文献也好!跪谢啊!!!!
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最新回复
wanglaoshi (2016-2-16 22:09:54)
jiushikeshui371 (2016-2-16 22:10:16)
不请自来 (2016-2-16 22:11:07)
问题是提取的DNA模板也不能用不带GC的引物扩增,只要换引物就残疾
sunbent (2016-2-16 22:11:21)
不请自来 (2016-2-16 22:17:57)
QUOTE:
天根的热启动mix了,如果有抑制剂,怎么带GC的能P出很亮很亮的目的条带呢yyaxw84 (2016-2-16 22:18:22)
不请自来 (2016-2-16 22:18:47)
QUOTE:
就是用第一次的PCR结果为模板再做一次条件和体系都相同的PCR?这个我试试不请自来 (2016-2-16 22:19:13)
QUOTE:
还没做过纯菌的呢seagate (2016-2-16 22:19:36)
你查查二次PCR的体系吧,网上有,另外,程序的话退火10个就够了!散金啊(*^^*)
seagate (2016-2-16 22:19:53)
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嗯,怀疑这个不带GC夹子的引物有问题,建议用纯菌试试,或是干脆更换新的引物,别忘了阳性对照
chengjie79 (2016-2-16 22:20:10)
不请自来 (2016-2-16 22:20:33)
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确实是引物的问题,谢谢啦,问题已经解决了
不请自来 (2016-2-16 22:20:57)
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谢谢啦,是正反引物浓度不对称导致,还是谢谢啦!祝你实验顺利!
不请自来 (2016-2-16 22:21:20)
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谢谢,问题已经解决,是引物的问题呢
#甜# (2016-2-16 22:21:43)
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这样啊,那我以后用到的时候,也应该注意一下了
mybioon (2016-2-16 22:22:15)
问题是提取的DNA模板也不能用不带GC的引物扩增,只要换引物就残疾...
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找到问题了吗?
建议:连扩两次;或者引物也可能有问题;再者有无GC,P的条件也是要适当变化的,有调整吗?
redbutterfly (2016-2-16 22:22:33)
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