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[求助]各位专家,请过来看看,我没法解决这个问题了
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各位大侠!我都快郁闷死了,我的PCR扩增总是不稳定,同样一个标本做复管,同时放进PCR仪中扩增,可结果不同,一管阳性,另一管却为阴性!像这样的结果做过很多次了。曾经考虑过是PCR仪器的问题,可好像不是。别人都说是我的扩增系统不稳定,可我真的不知道该怎么做了。我已经降低了退火温度,镁离子浓度也已经提高了,我还应该怎么办?请各位支个招吧!!! 救救我吧!
我的nested PCR扩增是这样的:
第一轮:
10×buffer 5ul
MgCl2 5ul (终浓度:2.5mM)
dNTPs 1ul (终浓度:0.2mM)
Primer1 1.6ul (终浓度:0.4mM)
Primer2 1.6ul (终浓度:0.4mM)
Taq酶 2U
模板用的是2ug
第一轮扩增循环是:95度预变性5分钟,94度1分钟、54度1分钟、72度1分 钟,共30个循环,最后一个循环延伸时间为8分钟。
第二轮:
10×buffer 2.5ul
MgCl2 2.5ul (终浓度:2.5mM)
dNTPs 0.5ul (终浓度:0.2mM)
Primer3 1ul (终浓度:1mM)
Primer4 1ul (终浓度:1mM)
Taq酶 1U
第二轮扩增时模板用的是第一轮扩增产1ul。
第二轮扩增循环是: 94度1分钟、60度1分钟、72度1分钟,共30个循环,最后一个循环延伸时间为8分钟。
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最新回复
=菓子= (2011-10-19 15:02:09)
做个体系标准管后,再分装到各个EP管中可以消除加样不准的问题.
(cat) (2011-10-19 15:02:34)
几点小建议:
1. 我们作nest-PCR时,都是习惯将第一轮扩增产物取出2ul,稀释20倍,
然后在第二轮中加1ul使用。我觉得你直接用1ul,量太多,有时模板太多也会抑制扩增的;
2. 扩增不佳时,Taq的用量可以增加一下,比如,50ul体系用Taq 2.5U
3. 你的第二轮中引物浓度以及退火温度是否有点高呢?
good luck!
bs4665 (2011-10-19 15:03:12)
bs4665 (2011-10-19 15:05:29)
各位专家,请帮帮忙吧!我真的不知道该怎么办了!
菠萝菠萝蜜 (2011-10-19 15:05:56)
mamamiya (2011-10-19 15:06:23)
韩梅梅 (2011-10-19 15:06:47)
smile_smile (2011-10-19 15:07:23)
不懂 (2011-10-19 15:08:15)
bs4665 (2011-10-19 15:09:09)
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