【求助】如何根据基因的rs号查是哪个点的SNP

字体: 小中大 | 打印发表于: 2016-4-04 10:22 作者: 小鱼鱼来源: 分析测试百科网

刚接手一个数据库，里面都是rs号，也没有说明是哪个基因，好容易搜到了是某个基因的一些点，但却不知道怎么和文献发表的结果对应。因为大多数文献都是发表的A数字C，或直接表示为氨基酸改变。
怎么确定这种对应关系啊。谢谢高手们！

大尾巴 (2016-4-04 10:23:09)

这个工作量很大的，我也不知道简便的方法。用的都是土方法，利用rs号，直接在NCBI的SNP库里确定是那个基因的。想找到相关的文献，我一直没有找到解决方法
楼主有好的方法，还望告知
黄花菜 (2016-4-04 10:23:28)

可不可以先根据基因到omim
HGVS cuturl('www.hgvs.org/')
HGMD cuturl('www.hgmd.cf.ac.uk/')
DAGdb
cuturl('www.ebi.ac.uk/mutations/')
数据库里去找，那里收录了很多和疾病有关的SNP
utt0989 (2016-4-04 10:26:08)

那个不全
viviwang1987 (2016-4-04 10:27:18)

polydoms 网站cuturl('http://polydoms.cchmc.org/polydoms/')
可以批量输入rs号进行查询
damingxia0904 (2016-4-04 10:27:35)

各位，告诉你们RS号是唯一的，只要知道这个号，就很方便的知道序列和基因了，想知道的来问我
wzqzy (2016-4-04 10:27:59)

有时多个rS号是指一个位点。
vvmmoy (2016-4-04 10:28:42)

我也一样啊，手头有一批SNP的RS号，想知道位于基因的什么位置~~ 楼主有答案了吗？
avi317 (2016-4-04 10:29:30)

各位楼楼有答案了吗？俺刚开始做这方面的研究，请教啊！
了了 (2016-4-04 10:29:53)

我也一样啊，手头有一批SNP的RS号，想知道位于基因的什么位置~~ 楼主有答案了吗？

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请问你后来找到方法了吗？
yhtfyl (2023-2-24 07:38:03)

感谢楼主分享，受教了
yhtfyl (2023-2-24 07:38:25)

感谢楼主分享，受教了