【转帖】我三年来关于AFLP的科研体会,服务大家

各位战友,如果你是奋战在AFLP的战场上,我想说的是无论何时你一定得战胜平时科研中得难以名状得痛苦,甚至是老师和同学不以理解得寂寞。
AFLP的确是种技术难度很高得分子标记,从酶切到银染,步步艰辛。往往分子标记大家都觉得以PCR为基础,不至于太难,其实做出来AFLP,尤其是做出好的结果真不是件容易的事儿。
我曾经在研究生第一年没有任何结果,建立方法和平台都不知道从哪里下手,身边没有一个可以帮助我的人。我是强烈的推荐和感谢DXY,战友教会了我太多的东西,恨不得在毕业论文里致谢了。
我把我摸索出来的实验体系公布出来,献给帮助我成长的DXY:
1 DNA提取采用改进的CTAB法
2 限制性消化与接头连接
2..1酶切反应体系为:
DNA(100ng/μl) 2.5μl
MseI(12U/μl) 0.25μl
EcoRI (10u/μl) 0.25μl
Buffer 4μl
BSA 0.2μl
ddH2O 12.7μl
2.2 酶切反应条件为:
37℃酶切 3h
72℃ 10min
2.3 连接体系为:
酶切完成的DNA样品 5μl
MA(25μmol/L) 1.0μl
EA(5μmol/L) 0.5μl
ATP(10mmol/L) 0.25μl
T4 DNA连接酶(3U/μl) 0.15μl
Buffer 1.0μl
ddH2O 2.1μl
2.4 连接反应条件为:
16℃ 连接过夜
3 预扩增
3 1预扩增反应体系为:
连接完成的DNA样品 1.0μl
M00(50ng/μl) 0.6μl
E00(50ng/μl) 0.6μl
10×PCR Buffer 2.0μl
Taq酶(5U/μl) 0.2μl
dNTP(10m mol/L) 0.4μl
ddH2O 15.2μl
混合后加1滴石蜡油,进行预扩增。