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【求助】如图,质谱分析结果中
如图,质谱分析结果中,peptide sequence那一行,括号是什么意思,哪一段才是多肽勒【求助】如图,质谱分析结果中
Peptide sequencee
(K)LVNKIQK(L)
这里的括号是什么意思,那这段多肽包括括号里的内容还是怎么?
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字体: 小 中 大 | 打印 发表于: 2016-4-28 11:09 作者: 灵魂 来源: 分析测试百科网
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最新回复
malong (2016-4-28 11:09:39)
大大 (2016-4-28 11:10:04)
大花猫bb (2016-4-28 11:10:34)
兔子 (2016-4-28 11:10:57)
要么可能是不确定到底是哪个氨基酸,所以打了个括号
你认为哪种可能性比较大啊
danzi (2016-4-28 11:11:19)
hcy517 (2016-4-28 11:11:39)
这个蛋白应该是trypsin酶解完再去做MALDI的吧?不知道lz有没有注意到,前面一个括号里的氨基酸都是R和K,而后面一个括号里的氨基酸的前面一个氨基酸也都是R和K,就是trypsin的酶切位点。
frgmentaion里面对应的就是该断多肽在该蛋白上的位置,把这个排一排,还可以大概知道这个PMF的序列覆盖度。
p1900 (2016-4-28 11:12:01)
钻石 (2016-4-28 11:12:31)
最后一列是氨基酸上的modification 1Met是Methionine上有oxidation这个是经常有的无所谓。最后一个1 PO4是磷酸化,但你没做MS2无法确定是哪一个,一般来说是T threonine上面
兔子 (2016-4-28 11:12:53)
mimima (2016-4-28 11:13:17)
huali (2016-4-28 11:13:41)
兔子 (2016-4-28 11:14:02)
danzi (2016-4-28 11:14:57)
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