香港大学领衔猩红热病原菌基因组研究

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香港大学领衔猩红热病原菌基因组研究
今年猩红热疫情在香港呈现出异常高发的趋势。截止到目前为止,共有466名儿童被感染,其中两人死亡。猩红热的病原体是化脓链球菌(Streptococcus  pyogenes),该病菌可通过皮肤伤口或者唾液(空气飞沫)传播。通常春夏之交是猩红热的高发期,但从今年香港感染人数的增长趋势来看,高峰期可能会持续整个夏天。



经香港卫生署指示,香港大学及相关合作单位完成并公布了新近爆发猩红热病菌的基因组草图(NCBI序号SRA038808。ftp://ftp.genomics.org.cn/pub/S.pyogenes/)。根据目前的分析结果,研究人员发现该菌株属于M12型链球菌,该型链球菌在欧洲、南北美洲以及亚洲都有分布,以前并未显示出异常的毒力特征。由于以前发表的两株链球菌全基因组序列只能覆盖这次流行菌株的95.2%,该菌株的特有序列可能是导致毒力及传播能力增强的重要原因。



香港大学及相关单位正在继续对病菌进行紧张的研究,预期将在一周内完成更精细的基因组图谱绘制。并将与香港以前分离到的链球菌菌株进行比较基因组学分析,寻找该致病菌株特有序列的来源和变异规律,以期为更好的控制疫情、防止疫情蔓延提供科学依据。



据悉,目前的基因草图和初步分析结果为香港大学和香港华大基因(BGI-HongKong)共同完成。早些时候,华大基因曾与德国汉堡医学院合作率先完成今年德国致病大肠杆菌的草图和完成图。
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