罗氏开发第三代纳米孔测序技术

罗氏与亚利桑那科技公司（Arizona Technology Enterprises，AzTE）今天宣布，罗氏从亚利桑那州立大学的Biodesign研究所和哥伦比亚大学纳米科学中心获得了一些技术授权，以开发一种全新的DNA测序系统。



这些纳米孔技术属于第三代测序技术，它们是由Biodesign研究所的Stuart Lindsay博士和哥伦比亚大学的Colin Nuckolls博士开发的。当DNA分子穿过纳米孔时，它们采用一种新颖的方法来读取单个DNA分子中的碱基序列。该研究小组已经展示了概念验证，正在制造第三代读取仪，以更好地区分DNA碱基。与罗氏达成授权协议有助于将这些发现转化成一台商业化的仪器。



Stuart Lindsay博士，Biodesign研究所单分子生物物理中心的主管，表示：“我们这项很有前途的技术融合了物理学、电子学和纳米技术的新进展，无需使用化学试剂，即可读取个人的基因组。”



罗氏旗下454生命科学的总裁Thomas Schinecker则认为，Biodesign研究所的DNA读取技术是目前最先进的，将在他们目前开发的纳米孔测序系统中起到重要作用。“它将与DNA Transistor技术很好地互补，形成一个卓越平台的核心，实现超快、超低价的基因组测序。”



Schinecker先生所提到的DNA Transistor技术是由IBM公司研发的。去年7月，罗氏和IBM公司宣布将共同开发基于纳米孔的测序技术，来快速高效地对人类DNA进行直接读取和测序。通过这两种技术的结合，他们预计，人类基因组的测序费用有望降至1000美元以下。



当DNA分子进入芯片上的纳米孔时，IBM的DNA Transistor技术减慢并控制DNA分子。而当它穿过纳米孔时，今天授权的这些技术将解码DNA碱基。根据罗氏和亚利桑那科技公司的说法，这两种技术都是基于半导体纳米孔，与那些基于蛋白的纳米孔相比，在控制力、可靠性、扩展性和制造能力上均有优势。



罗氏目前提供两种测序平台：高通量的GS FLX+ 系统和精巧型的GS Junior系统。全新的GS FLX+系统能够产生高达1,000 bp的测序读长，赶超了传统的毛细管电泳测序法。读长的改善也使得通量提升了近50%，达到1 Gb，从而降低了大型测序项目的测序成本。GS Junior则以小巧的体积、低廉的价格，引领基因组学研究跨入实时个人测序的全新时代.