【求助】请问MALDI-TOF-TOF的二级谱图出峰不好的原因？

最新回复

• 2541 (2014-6-18 16:33:34)

  
  用的是啥子质谱？
  bruker 的还是ABI4700?
  二级谱图出峰不好的原因：
  一：峰的强度较低
  二：肽段本身难以断裂
  出峰不好得到的肽序列会可靠吗？
  是PMF+ms/ms 的结果吗？

• shenkunjie (2014-6-18 16:33:54)

  
  
  对一级PMF没影响，完全有可能。

• dragonkilly (2014-6-18 16:34:30)

  
  用的是ABI4700－TOF-TOF。
  他们没有给我提供二级的肽序列结果，只是PMF结果。
  他们说当时仪器有点问题，做二级时谱图虽然不漂亮，但是软件却有强大的分析功能，能够分析出肽序列。可是仪器有点问题，对一级PMF就没影响吗？
  请问这样对吗？
  因为我对TOF-TOF不太懂。

• dragonkilly (2014-6-18 16:34:48)

  QUOTE:

  原帖由 shenkunjie 于 2014-6-18 16:33 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')
  
  
  对一级PMF没影响，完全有可能。

  
  请问为什么对一级PMF可以没影响，而会影响二级呢？
  仪器有点问题，指的是什么意思呢？

• shenkunjie (2014-6-18 16:35:11)

  QUOTE:

  原帖由 dragonkilly 于 2014-6-18 16:34 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')
  
  
  
  请问为什么对一级PMF可以没影响，而会影响二级呢？
  仪器有点问题，指的是什么意思呢？

  因为二级的ms/ms需要一定强度的一级离子才打的好看

• zranqi_1 (2014-6-18 16:35:31)

  做实验又不是找女人，图要那么漂亮干嘛？
  不漂亮的图你也可以要求他们给你。
  贴上一起看看。
  你在哪做的4700？

• feima+ (2014-6-18 16:35:51)

  
  1.检查你的胰酶,Promega Golden Trypsin 不错
  2.酶解要充分,不要怕自切
  3.ESI源万不可用Ziptip除盐,因为质谱自带C18脱盐柱
  4.蛋白回收要充分

• yonger (2014-6-18 16:36:09)

  
  做质谱的单位如果设备没调好的话，出的结果是不可信的。